Protein–RNA interactions for Protein: Q149F3

Gspt2, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3B, mousemouse

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Length 632 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gspt2Q149F3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gspt2Q149F3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Gspt2Q149F3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gspt2Q149F3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gspt2Q149F3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Gspt2Q149F3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gspt2Q149F3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Gspt2Q149F3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gspt2Q149F3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Gspt2Q149F3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gspt2Q149F3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Gspt2Q149F3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gspt2Q149F3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gspt2Q149F3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gspt2Q149F3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gspt2Q149F3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gspt2Q149F3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gspt2Q149F3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gspt2Q149F3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gspt2Q149F3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gspt2Q149F3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gspt2Q149F3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gspt2Q149F3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Gspt2Q149F3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gspt2Q149F3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gspt2Q149F3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gspt2Q149F3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gspt2Q149F3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gspt2Q149F3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gspt2Q149F3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gspt2Q149F3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gspt2Q149F3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gspt2Q149F3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gspt2Q149F3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gspt2Q149F3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gspt2Q149F3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gspt2Q149F3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gspt2Q149F3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gspt2Q149F3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gspt2Q149F3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gspt2Q149F3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gspt2Q149F3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gspt2Q149F3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gspt2Q149F3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gspt2Q149F3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gspt2Q149F3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gspt2Q149F3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gspt2Q149F3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gspt2Q149F3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gspt2Q149F3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gspt2Q149F3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gspt2Q149F3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gspt2Q149F3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gspt2Q149F3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gspt2Q149F3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gspt2Q149F3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Gspt2Q149F3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gspt2Q149F3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gspt2Q149F3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gspt2Q149F3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gspt2Q149F3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gspt2Q149F3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gspt2Q149F3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gspt2Q149F3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gspt2Q149F3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gspt2Q149F3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gspt2Q149F3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gspt2Q149F3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gspt2Q149F3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gspt2Q149F3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gspt2Q149F3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gspt2Q149F3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gspt2Q149F3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gspt2Q149F3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gspt2Q149F3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gspt2Q149F3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gspt2Q149F3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Gspt2Q149F3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gspt2Q149F3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gspt2Q149F3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gspt2Q149F3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gspt2Q149F3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gspt2Q149F3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gspt2Q149F3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gspt2Q149F3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gspt2Q149F3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gspt2Q149F3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gspt2Q149F3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gspt2Q149F3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gspt2Q149F3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gspt2Q149F3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gspt2Q149F3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gspt2Q149F3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gspt2Q149F3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gspt2Q149F3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gspt2Q149F3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gspt2Q149F3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gspt2Q149F3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gspt2Q149F3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gspt2Q149F3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms