Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBN2

Dsel, Dermatan-sulfate epimerase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DselQ0VBN2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
DselQ0VBN2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DselQ0VBN2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DselQ0VBN2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DselQ0VBN2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DselQ0VBN2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DselQ0VBN2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
DselQ0VBN2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DselQ0VBN2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
DselQ0VBN2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DselQ0VBN2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DselQ0VBN2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
DselQ0VBN2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DselQ0VBN2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
DselQ0VBN2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DselQ0VBN2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DselQ0VBN2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DselQ0VBN2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DselQ0VBN2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DselQ0VBN2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DselQ0VBN2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DselQ0VBN2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DselQ0VBN2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DselQ0VBN2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DselQ0VBN2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
DselQ0VBN2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
DselQ0VBN2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DselQ0VBN2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DselQ0VBN2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DselQ0VBN2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DselQ0VBN2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DselQ0VBN2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DselQ0VBN2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DselQ0VBN2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DselQ0VBN2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DselQ0VBN2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DselQ0VBN2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DselQ0VBN2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DselQ0VBN2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DselQ0VBN2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DselQ0VBN2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DselQ0VBN2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DselQ0VBN2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DselQ0VBN2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DselQ0VBN2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DselQ0VBN2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DselQ0VBN2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DselQ0VBN2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DselQ0VBN2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DselQ0VBN2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DselQ0VBN2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DselQ0VBN2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DselQ0VBN2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DselQ0VBN2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DselQ0VBN2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DselQ0VBN2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DselQ0VBN2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DselQ0VBN2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DselQ0VBN2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DselQ0VBN2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DselQ0VBN2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DselQ0VBN2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DselQ0VBN2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DselQ0VBN2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DselQ0VBN2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DselQ0VBN2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DselQ0VBN2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DselQ0VBN2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DselQ0VBN2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DselQ0VBN2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DselQ0VBN2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DselQ0VBN2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DselQ0VBN2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DselQ0VBN2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DselQ0VBN2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DselQ0VBN2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DselQ0VBN2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DselQ0VBN2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DselQ0VBN2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DselQ0VBN2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DselQ0VBN2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DselQ0VBN2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DselQ0VBN2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DselQ0VBN2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DselQ0VBN2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DselQ0VBN2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DselQ0VBN2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DselQ0VBN2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DselQ0VBN2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DselQ0VBN2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DselQ0VBN2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DselQ0VBN2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DselQ0VBN2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DselQ0VBN2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DselQ0VBN2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DselQ0VBN2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DselQ0VBN2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DselQ0VBN2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DselQ0VBN2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DselQ0VBN2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms