Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Stx2Q00262 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Stx2Q00262 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Stx2Q00262 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Stx2Q00262 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Stx2Q00262 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Stx2Q00262 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Stx2Q00262 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Stx2Q00262 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Stx2Q00262 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Stx2Q00262 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Stx2Q00262 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Stx2Q00262 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Stx2Q00262 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Stx2Q00262 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Stx2Q00262 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Stx2Q00262 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Stx2Q00262 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Stx2Q00262 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Stx2Q00262 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Stx2Q00262 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Stx2Q00262 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Stx2Q00262 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Stx2Q00262 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Stx2Q00262 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Stx2Q00262 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Stx2Q00262 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Stx2Q00262 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Stx2Q00262 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Stx2Q00262 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Stx2Q00262 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Stx2Q00262 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stx2Q00262 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stx2Q00262 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Stx2Q00262 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Stx2Q00262 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Stx2Q00262 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stx2Q00262 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stx2Q00262 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Stx2Q00262 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stx2Q00262 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stx2Q00262 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stx2Q00262 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stx2Q00262 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stx2Q00262 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stx2Q00262 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Stx2Q00262 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stx2Q00262 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stx2Q00262 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stx2Q00262 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Stx2Q00262 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stx2Q00262 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stx2Q00262 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stx2Q00262 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stx2Q00262 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stx2Q00262 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stx2Q00262 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Stx2Q00262 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx2Q00262 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stx2Q00262 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stx2Q00262 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stx2Q00262 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stx2Q00262 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stx2Q00262 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stx2Q00262 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx2Q00262 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stx2Q00262 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stx2Q00262 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stx2Q00262 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stx2Q00262 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx2Q00262 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx2Q00262 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stx2Q00262 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stx2Q00262 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stx2Q00262 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stx2Q00262 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx2Q00262 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stx2Q00262 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx2Q00262 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stx2Q00262 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx2Q00262 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx2Q00262 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stx2Q00262 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stx2Q00262 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stx2Q00262 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stx2Q00262 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stx2Q00262 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx2Q00262 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx2Q00262 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stx2Q00262 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Stx2Q00262 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stx2Q00262 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stx2Q00262 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx2Q00262 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stx2Q00262 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx2Q00262 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx2Q00262 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stx2Q00262 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Stx2Q00262 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stx2Q00262 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms