Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
H2-Q6P79568 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
H2-Q6P79568 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
H2-Q6P79568 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
H2-Q6P79568 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
H2-Q6P79568 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
H2-Q6P79568 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
H2-Q6P79568 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
H2-Q6P79568 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
H2-Q6P79568 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H2-Q6P79568 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
H2-Q6P79568 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H2-Q6P79568 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
H2-Q6P79568 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H2-Q6P79568 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
H2-Q6P79568 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
H2-Q6P79568 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
H2-Q6P79568 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
H2-Q6P79568 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
H2-Q6P79568 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
H2-Q6P79568 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
H2-Q6P79568 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
H2-Q6P79568 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
H2-Q6P79568 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H2-Q6P79568 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H2-Q6P79568 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H2-Q6P79568 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
H2-Q6P79568 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H2-Q6P79568 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
H2-Q6P79568 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H2-Q6P79568 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
H2-Q6P79568 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H2-Q6P79568 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H2-Q6P79568 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H2-Q6P79568 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H2-Q6P79568 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H2-Q6P79568 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H2-Q6P79568 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
H2-Q6P79568 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H2-Q6P79568 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
H2-Q6P79568 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H2-Q6P79568 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
H2-Q6P79568 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H2-Q6P79568 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H2-Q6P79568 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H2-Q6P79568 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
H2-Q6P79568 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H2-Q6P79568 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H2-Q6P79568 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
H2-Q6P79568 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H2-Q6P79568 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H2-Q6P79568 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
H2-Q6P79568 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H2-Q6P79568 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H2-Q6P79568 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-Q6P79568 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H2-Q6P79568 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2-Q6P79568 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2-Q6P79568 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2-Q6P79568 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
H2-Q6P79568 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
H2-Q6P79568 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
H2-Q6P79568 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
H2-Q6P79568 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
H2-Q6P79568 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2-Q6P79568 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2-Q6P79568 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2-Q6P79568 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2-Q6P79568 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2-Q6P79568 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2-Q6P79568 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2-Q6P79568 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2-Q6P79568 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2-Q6P79568 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2-Q6P79568 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2-Q6P79568 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2-Q6P79568 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2-Q6P79568 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2-Q6P79568 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2-Q6P79568 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2-Q6P79568 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2-Q6P79568 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2-Q6P79568 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2-Q6P79568 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H2-Q6P79568 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H2-Q6P79568 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H2-Q6P79568 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H2-Q6P79568 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2-Q6P79568 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2-Q6P79568 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2-Q6P79568 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
H2-Q6P79568 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2-Q6P79568 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2-Q6P79568 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2-Q6P79568 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2-Q6P79568 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2-Q6P79568 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
H2-Q6P79568 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2-Q6P79568 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-Q6P79568 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms