Protein–RNA interactions for Protein: P70169

Doc2b, Double C2-like domain-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Doc2bP70169 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Doc2bP70169 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Doc2bP70169 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Doc2bP70169 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Doc2bP70169 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Doc2bP70169 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Doc2bP70169 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Doc2bP70169 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Doc2bP70169 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Doc2bP70169 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Doc2bP70169 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Doc2bP70169 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Doc2bP70169 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Doc2bP70169 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Doc2bP70169 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Doc2bP70169 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Doc2bP70169 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Doc2bP70169 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Doc2bP70169 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Doc2bP70169 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Doc2bP70169 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Doc2bP70169 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Doc2bP70169 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Doc2bP70169 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Doc2bP70169 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Doc2bP70169 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Doc2bP70169 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Doc2bP70169 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Doc2bP70169 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Doc2bP70169 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Doc2bP70169 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Doc2bP70169 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Doc2bP70169 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Doc2bP70169 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Doc2bP70169 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Doc2bP70169 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Doc2bP70169 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Doc2bP70169 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Doc2bP70169 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Doc2bP70169 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Doc2bP70169 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Doc2bP70169 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Doc2bP70169 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Doc2bP70169 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Doc2bP70169 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Doc2bP70169 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Doc2bP70169 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Doc2bP70169 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Doc2bP70169 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Doc2bP70169 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Doc2bP70169 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Doc2bP70169 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Doc2bP70169 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Doc2bP70169 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Doc2bP70169 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Doc2bP70169 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Doc2bP70169 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Doc2bP70169 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Doc2bP70169 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Doc2bP70169 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Doc2bP70169 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Doc2bP70169 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Doc2bP70169 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Doc2bP70169 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Doc2bP70169 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Doc2bP70169 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Doc2bP70169 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Doc2bP70169 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Doc2bP70169 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Doc2bP70169 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Doc2bP70169 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Doc2bP70169 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Doc2bP70169 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Doc2bP70169 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Doc2bP70169 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Doc2bP70169 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Doc2bP70169 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Doc2bP70169 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Doc2bP70169 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Doc2bP70169 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Doc2bP70169 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Doc2bP70169 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Doc2bP70169 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Doc2bP70169 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Doc2bP70169 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Doc2bP70169 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Doc2bP70169 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Doc2bP70169 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Doc2bP70169 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Doc2bP70169 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Doc2bP70169 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Doc2bP70169 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Doc2bP70169 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Doc2bP70169 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Doc2bP70169 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Doc2bP70169 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Doc2bP70169 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Doc2bP70169 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Doc2bP70169 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Doc2bP70169 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms