Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab3cP62823 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rab3cP62823 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rab3cP62823 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rab3cP62823 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Rab3cP62823 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab3cP62823 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab3cP62823 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab3cP62823 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rab3cP62823 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab3cP62823 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab3cP62823 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rab3cP62823 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab3cP62823 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab3cP62823 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab3cP62823 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3cP62823 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3cP62823 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3cP62823 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab3cP62823 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab3cP62823 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3cP62823 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab3cP62823 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab3cP62823 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab3cP62823 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab3cP62823 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3cP62823 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3cP62823 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3cP62823 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3cP62823 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3cP62823 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3cP62823 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3cP62823 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3cP62823 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3cP62823 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab3cP62823 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab3cP62823 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3cP62823 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab3cP62823 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab3cP62823 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab3cP62823 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3cP62823 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3cP62823 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab3cP62823 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab3cP62823 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3cP62823 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3cP62823 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3cP62823 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3cP62823 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3cP62823 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3cP62823 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3cP62823 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3cP62823 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3cP62823 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3cP62823 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab3cP62823 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3cP62823 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3cP62823 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3cP62823 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3cP62823 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3cP62823 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3cP62823 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3cP62823 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3cP62823 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3cP62823 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab3cP62823 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab3cP62823 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab3cP62823 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab3cP62823 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab3cP62823 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab3cP62823 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab3cP62823 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab3cP62823 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab3cP62823 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab3cP62823 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab3cP62823 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab3cP62823 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab3cP62823 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab3cP62823 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab3cP62823 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab3cP62823 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab3cP62823 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab3cP62823 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab3cP62823 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3cP62823 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab3cP62823 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab3cP62823 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3cP62823 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3cP62823 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab3cP62823 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3cP62823 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3cP62823 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3cP62823 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3cP62823 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3cP62823 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3cP62823 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab3cP62823 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab3cP62823 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab3cP62823 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab3cP62823 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms