Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Stx1bP61264 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Stx1bP61264 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Stx1bP61264 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Stx1bP61264 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Stx1bP61264 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Stx1bP61264 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Stx1bP61264 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Stx1bP61264 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Stx1bP61264 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Stx1bP61264 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Stx1bP61264 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Stx1bP61264 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Stx1bP61264 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Stx1bP61264 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Stx1bP61264 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Stx1bP61264 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Stx1bP61264 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Stx1bP61264 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Stx1bP61264 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stx1bP61264 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stx1bP61264 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Stx1bP61264 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stx1bP61264 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stx1bP61264 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stx1bP61264 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stx1bP61264 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stx1bP61264 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Stx1bP61264 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stx1bP61264 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stx1bP61264 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stx1bP61264 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stx1bP61264 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stx1bP61264 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stx1bP61264 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stx1bP61264 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stx1bP61264 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stx1bP61264 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Stx1bP61264 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx1bP61264 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stx1bP61264 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stx1bP61264 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stx1bP61264 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stx1bP61264 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stx1bP61264 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx1bP61264 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx1bP61264 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx1bP61264 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stx1bP61264 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx1bP61264 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Stx1bP61264 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stx1bP61264 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx1bP61264 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stx1bP61264 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx1bP61264 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx1bP61264 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stx1bP61264 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stx1bP61264 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stx1bP61264 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stx1bP61264 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stx1bP61264 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Stx1bP61264 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Stx1bP61264 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx1bP61264 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx1bP61264 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx1bP61264 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stx1bP61264 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stx1bP61264 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stx1bP61264 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx1bP61264 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Stx1bP61264 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stx1bP61264 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stx1bP61264 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stx1bP61264 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stx1bP61264 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stx1bP61264 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx1bP61264 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stx1bP61264 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Stx1bP61264 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stx1bP61264 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stx1bP61264 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx1bP61264 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stx1bP61264 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx1bP61264 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx1bP61264 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx1bP61264 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx1bP61264 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx1bP61264 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx1bP61264 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx1bP61264 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx1bP61264 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stx1bP61264 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stx1bP61264 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stx1bP61264 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stx1bP61264 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stx1bP61264 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stx1bP61264 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stx1bP61264 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stx1bP61264 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stx1bP61264 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms