Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lad1P57016 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Lad1P57016 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lad1P57016 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lad1P57016 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Lad1P57016 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lad1P57016 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lad1P57016 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lad1P57016 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lad1P57016 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lad1P57016 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lad1P57016 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lad1P57016 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lad1P57016 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lad1P57016 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lad1P57016 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Lad1P57016 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lad1P57016 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lad1P57016 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lad1P57016 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lad1P57016 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lad1P57016 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lad1P57016 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lad1P57016 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Lad1P57016 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lad1P57016 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lad1P57016 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lad1P57016 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lad1P57016 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lad1P57016 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lad1P57016 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lad1P57016 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Lad1P57016 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lad1P57016 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lad1P57016 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lad1P57016 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lad1P57016 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lad1P57016 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lad1P57016 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Lad1P57016 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lad1P57016 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lad1P57016 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lad1P57016 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lad1P57016 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lad1P57016 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lad1P57016 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lad1P57016 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lad1P57016 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lad1P57016 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lad1P57016 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lad1P57016 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lad1P57016 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lad1P57016 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lad1P57016 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lad1P57016 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lad1P57016 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lad1P57016 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lad1P57016 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lad1P57016 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lad1P57016 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lad1P57016 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lad1P57016 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lad1P57016 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lad1P57016 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lad1P57016 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lad1P57016 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lad1P57016 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lad1P57016 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lad1P57016 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lad1P57016 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lad1P57016 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lad1P57016 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lad1P57016 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lad1P57016 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lad1P57016 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lad1P57016 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lad1P57016 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lad1P57016 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lad1P57016 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lad1P57016 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lad1P57016 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lad1P57016 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lad1P57016 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lad1P57016 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lad1P57016 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lad1P57016 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lad1P57016 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lad1P57016 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lad1P57016 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lad1P57016 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lad1P57016 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lad1P57016 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lad1P57016 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lad1P57016 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lad1P57016 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lad1P57016 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lad1P57016 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lad1P57016 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lad1P57016 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lad1P57016 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms