Protein–RNA interactions for Protein: P53347

Osm, Oncostatin-M, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OsmP53347 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
OsmP53347 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OsmP53347 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OsmP53347 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OsmP53347 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OsmP53347 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
OsmP53347 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OsmP53347 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OsmP53347 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
OsmP53347 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OsmP53347 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OsmP53347 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OsmP53347 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OsmP53347 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
OsmP53347 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OsmP53347 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OsmP53347 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OsmP53347 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OsmP53347 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OsmP53347 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OsmP53347 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OsmP53347 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OsmP53347 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OsmP53347 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OsmP53347 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OsmP53347 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OsmP53347 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OsmP53347 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OsmP53347 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OsmP53347 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OsmP53347 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OsmP53347 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OsmP53347 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OsmP53347 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OsmP53347 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OsmP53347 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OsmP53347 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OsmP53347 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OsmP53347 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OsmP53347 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OsmP53347 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OsmP53347 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OsmP53347 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OsmP53347 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OsmP53347 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OsmP53347 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OsmP53347 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OsmP53347 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OsmP53347 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OsmP53347 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OsmP53347 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OsmP53347 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OsmP53347 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OsmP53347 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OsmP53347 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OsmP53347 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OsmP53347 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OsmP53347 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OsmP53347 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OsmP53347 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OsmP53347 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OsmP53347 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OsmP53347 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OsmP53347 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OsmP53347 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OsmP53347 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OsmP53347 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OsmP53347 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OsmP53347 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OsmP53347 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OsmP53347 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OsmP53347 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OsmP53347 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OsmP53347 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OsmP53347 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OsmP53347 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OsmP53347 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OsmP53347 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OsmP53347 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OsmP53347 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OsmP53347 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OsmP53347 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OsmP53347 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OsmP53347 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OsmP53347 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OsmP53347 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OsmP53347 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OsmP53347 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OsmP53347 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OsmP53347 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OsmP53347 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OsmP53347 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OsmP53347 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OsmP53347 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OsmP53347 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OsmP53347 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OsmP53347 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OsmP53347 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OsmP53347 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OsmP53347 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms