Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Defa8P50706 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Defa8P50706 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Defa8P50706 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Defa8P50706 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Defa8P50706 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Defa8P50706 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Defa8P50706 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Defa8P50706 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Defa8P50706 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Defa8P50706 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Defa8P50706 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Defa8P50706 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Defa8P50706 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Defa8P50706 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Defa8P50706 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Defa8P50706 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Defa8P50706 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Defa8P50706 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Defa8P50706 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Defa8P50706 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Defa8P50706 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Defa8P50706 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Defa8P50706 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Defa8P50706 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Defa8P50706 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Defa8P50706 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Defa8P50706 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Defa8P50706 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Defa8P50706 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Defa8P50706 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Defa8P50706 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Defa8P50706 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Defa8P50706 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Defa8P50706 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Defa8P50706 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Defa8P50706 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Defa8P50706 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Defa8P50706 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Defa8P50706 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Defa8P50706 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Defa8P50706 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Defa8P50706 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Defa8P50706 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Defa8P50706 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Defa8P50706 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Defa8P50706 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Defa8P50706 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Defa8P50706 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Defa8P50706 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Defa8P50706 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Defa8P50706 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Defa8P50706 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Defa8P50706 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Defa8P50706 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Defa8P50706 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Defa8P50706 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Defa8P50706 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Defa8P50706 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Defa8P50706 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Defa8P50706 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Defa8P50706 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Defa8P50706 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Defa8P50706 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Defa8P50706 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Defa8P50706 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Defa8P50706 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Defa8P50706 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Defa8P50706 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Defa8P50706 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Defa8P50706 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Defa8P50706 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Defa8P50706 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Defa8P50706 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Defa8P50706 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Defa8P50706 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Defa8P50706 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Defa8P50706 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Defa8P50706 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Defa8P50706 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Defa8P50706 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Defa8P50706 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Defa8P50706 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Defa8P50706 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Defa8P50706 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Defa8P50706 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Defa8P50706 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Defa8P50706 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Defa8P50706 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Defa8P50706 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Defa8P50706 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Defa8P50706 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Defa8P50706 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Defa8P50706 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Defa8P50706 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Defa8P50706 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Defa8P50706 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Defa8P50706 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Defa8P50706 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Defa8P50706 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms