Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Capza1P47753 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Capza1P47753 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Capza1P47753 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Capza1P47753 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Capza1P47753 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Capza1P47753 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Capza1P47753 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Capza1P47753 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Capza1P47753 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Capza1P47753 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Capza1P47753 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Capza1P47753 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Capza1P47753 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Capza1P47753 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capza1P47753 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capza1P47753 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capza1P47753 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Capza1P47753 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Capza1P47753 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Capza1P47753 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Capza1P47753 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capza1P47753 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Capza1P47753 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capza1P47753 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Capza1P47753 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Capza1P47753 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capza1P47753 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capza1P47753 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Capza1P47753 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Capza1P47753 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Capza1P47753 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capza1P47753 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capza1P47753 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capza1P47753 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Capza1P47753 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capza1P47753 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capza1P47753 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capza1P47753 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capza1P47753 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capza1P47753 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Capza1P47753 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capza1P47753 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Capza1P47753 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Capza1P47753 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capza1P47753 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capza1P47753 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Capza1P47753 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Capza1P47753 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Capza1P47753 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capza1P47753 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capza1P47753 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capza1P47753 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Capza1P47753 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Capza1P47753 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capza1P47753 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capza1P47753 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capza1P47753 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Capza1P47753 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capza1P47753 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capza1P47753 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capza1P47753 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capza1P47753 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capza1P47753 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capza1P47753 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capza1P47753 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capza1P47753 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capza1P47753 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Capza1P47753 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capza1P47753 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capza1P47753 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capza1P47753 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capza1P47753 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capza1P47753 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capza1P47753 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capza1P47753 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capza1P47753 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capza1P47753 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capza1P47753 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capza1P47753 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capza1P47753 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capza1P47753 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capza1P47753 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capza1P47753 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capza1P47753 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capza1P47753 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capza1P47753 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capza1P47753 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capza1P47753 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capza1P47753 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capza1P47753 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capza1P47753 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capza1P47753 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capza1P47753 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capza1P47753 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capza1P47753 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capza1P47753 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capza1P47753 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capza1P47753 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Capza1P47753 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms