Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Elk3P41971 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Elk3P41971 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Elk3P41971 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Elk3P41971 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Elk3P41971 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Elk3P41971 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Elk3P41971 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Elk3P41971 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Elk3P41971 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Elk3P41971 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Elk3P41971 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Elk3P41971 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Elk3P41971 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Elk3P41971 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Elk3P41971 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Elk3P41971 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Elk3P41971 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Elk3P41971 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Elk3P41971 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Elk3P41971 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Elk3P41971 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Elk3P41971 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Elk3P41971 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Elk3P41971 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Elk3P41971 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Elk3P41971 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Elk3P41971 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Elk3P41971 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Elk3P41971 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Elk3P41971 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Elk3P41971 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Elk3P41971 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Elk3P41971 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Elk3P41971 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Elk3P41971 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Elk3P41971 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Elk3P41971 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Elk3P41971 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Elk3P41971 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Elk3P41971 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Elk3P41971 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Elk3P41971 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Elk3P41971 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Elk3P41971 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Elk3P41971 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Elk3P41971 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Elk3P41971 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Elk3P41971 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Elk3P41971 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Elk3P41971 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Elk3P41971 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Elk3P41971 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Elk3P41971 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Elk3P41971 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Elk3P41971 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Elk3P41971 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Elk3P41971 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Elk3P41971 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Elk3P41971 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Elk3P41971 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Elk3P41971 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Elk3P41971 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Elk3P41971 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Elk3P41971 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Elk3P41971 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Elk3P41971 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elk3P41971 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Elk3P41971 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Elk3P41971 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Elk3P41971 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Elk3P41971 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Elk3P41971 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Elk3P41971 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Elk3P41971 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Elk3P41971 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Elk3P41971 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Elk3P41971 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Elk3P41971 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Elk3P41971 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Elk3P41971 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Elk3P41971 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Elk3P41971 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Elk3P41971 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Elk3P41971 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Elk3P41971 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Elk3P41971 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Elk3P41971 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Elk3P41971 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Elk3P41971 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Elk3P41971 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Elk3P41971 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Elk3P41971 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Elk3P41971 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Elk3P41971 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Elk3P41971 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Elk3P41971 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Elk3P41971 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Elk3P41971 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Elk3P41971 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms