Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Tac1P41539 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Tac1P41539 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Tac1P41539 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tac1P41539 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Tac1P41539 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tac1P41539 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tac1P41539 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tac1P41539 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tac1P41539 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tac1P41539 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tac1P41539 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tac1P41539 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tac1P41539 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tac1P41539 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Tac1P41539 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tac1P41539 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Tac1P41539 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tac1P41539 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tac1P41539 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tac1P41539 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tac1P41539 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tac1P41539 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tac1P41539 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tac1P41539 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Tac1P41539 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tac1P41539 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tac1P41539 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tac1P41539 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Tac1P41539 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tac1P41539 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tac1P41539 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tac1P41539 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tac1P41539 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tac1P41539 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tac1P41539 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tac1P41539 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tac1P41539 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tac1P41539 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tac1P41539 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tac1P41539 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tac1P41539 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tac1P41539 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tac1P41539 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tac1P41539 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tac1P41539 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tac1P41539 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tac1P41539 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tac1P41539 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tac1P41539 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tac1P41539 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tac1P41539 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tac1P41539 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tac1P41539 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tac1P41539 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tac1P41539 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tac1P41539 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tac1P41539 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tac1P41539 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tac1P41539 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tac1P41539 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tac1P41539 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tac1P41539 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tac1P41539 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tac1P41539 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tac1P41539 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tac1P41539 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tac1P41539 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tac1P41539 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tac1P41539 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tac1P41539 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tac1P41539 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tac1P41539 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tac1P41539 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tac1P41539 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tac1P41539 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tac1P41539 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tac1P41539 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tac1P41539 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tac1P41539 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tac1P41539 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tac1P41539 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tac1P41539 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tac1P41539 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tac1P41539 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tac1P41539 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tac1P41539 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tac1P41539 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tac1P41539 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tac1P41539 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tac1P41539 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tac1P41539 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tac1P41539 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tac1P41539 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tac1P41539 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tac1P41539 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tac1P41539 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tac1P41539 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tac1P41539 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tac1P41539 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms