Protein–RNA interactions for Protein: P35285

Rab22a, Ras-related protein Rab-22A, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab22aP35285 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rab22aP35285 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rab22aP35285 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rab22aP35285 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab22aP35285 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab22aP35285 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab22aP35285 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab22aP35285 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab22aP35285 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab22aP35285 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab22aP35285 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab22aP35285 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab22aP35285 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab22aP35285 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab22aP35285 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab22aP35285 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab22aP35285 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab22aP35285 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab22aP35285 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab22aP35285 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab22aP35285 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rab22aP35285 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab22aP35285 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab22aP35285 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab22aP35285 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab22aP35285 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab22aP35285 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab22aP35285 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab22aP35285 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab22aP35285 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab22aP35285 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab22aP35285 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab22aP35285 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab22aP35285 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab22aP35285 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab22aP35285 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab22aP35285 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab22aP35285 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab22aP35285 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab22aP35285 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab22aP35285 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab22aP35285 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab22aP35285 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab22aP35285 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab22aP35285 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab22aP35285 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab22aP35285 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab22aP35285 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab22aP35285 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab22aP35285 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab22aP35285 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab22aP35285 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab22aP35285 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab22aP35285 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab22aP35285 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab22aP35285 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab22aP35285 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab22aP35285 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab22aP35285 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab22aP35285 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab22aP35285 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab22aP35285 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab22aP35285 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab22aP35285 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab22aP35285 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab22aP35285 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab22aP35285 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab22aP35285 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab22aP35285 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab22aP35285 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab22aP35285 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab22aP35285 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab22aP35285 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab22aP35285 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab22aP35285 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab22aP35285 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab22aP35285 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab22aP35285 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab22aP35285 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab22aP35285 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab22aP35285 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab22aP35285 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab22aP35285 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab22aP35285 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab22aP35285 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab22aP35285 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab22aP35285 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab22aP35285 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab22aP35285 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab22aP35285 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab22aP35285 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab22aP35285 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab22aP35285 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab22aP35285 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab22aP35285 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab22aP35285 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab22aP35285 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab22aP35285 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab22aP35285 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab22aP35285 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms