Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Gjc1P28229 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Gjc1P28229 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Gjc1P28229 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gjc1P28229 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gjc1P28229 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Gjc1P28229 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Gjc1P28229 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gjc1P28229 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Gjc1P28229 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gjc1P28229 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gjc1P28229 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gjc1P28229 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Gjc1P28229 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Gjc1P28229 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Gjc1P28229 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gjc1P28229 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gjc1P28229 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gjc1P28229 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Gjc1P28229 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gjc1P28229 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Gjc1P28229 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gjc1P28229 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gjc1P28229 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gjc1P28229 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gjc1P28229 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gjc1P28229 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gjc1P28229 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gjc1P28229 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Gjc1P28229 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gjc1P28229 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Gjc1P28229 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gjc1P28229 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Gjc1P28229 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Gjc1P28229 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gjc1P28229 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Gjc1P28229 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Gjc1P28229 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gjc1P28229 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Gjc1P28229 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gjc1P28229 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gjc1P28229 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gjc1P28229 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gjc1P28229 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gjc1P28229 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Gjc1P28229 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gjc1P28229 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gjc1P28229 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gjc1P28229 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Gjc1P28229 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gjc1P28229 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gjc1P28229 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gjc1P28229 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gjc1P28229 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gjc1P28229 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gjc1P28229 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gjc1P28229 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Gjc1P28229 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gjc1P28229 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gjc1P28229 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gjc1P28229 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gjc1P28229 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gjc1P28229 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Gjc1P28229 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gjc1P28229 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gjc1P28229 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gjc1P28229 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gjc1P28229 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Gjc1P28229 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gjc1P28229 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gjc1P28229 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gjc1P28229 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gjc1P28229 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gjc1P28229 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gjc1P28229 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gjc1P28229 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gjc1P28229 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gjc1P28229 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gjc1P28229 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gjc1P28229 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gjc1P28229 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Gjc1P28229 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gjc1P28229 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gjc1P28229 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gjc1P28229 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gjc1P28229 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gjc1P28229 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gjc1P28229 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Gjc1P28229 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gjc1P28229 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gjc1P28229 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjc1P28229 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjc1P28229 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gjc1P28229 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gjc1P28229 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gjc1P28229 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gjc1P28229 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gjc1P28229 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gjc1P28229 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjc1P28229 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms