Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Cst3P21460 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cst3P21460 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cst3P21460 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cst3P21460 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cst3P21460 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cst3P21460 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cst3P21460 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cst3P21460 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cst3P21460 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cst3P21460 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cst3P21460 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cst3P21460 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cst3P21460 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cst3P21460 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cst3P21460 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cst3P21460 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cst3P21460 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cst3P21460 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cst3P21460 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cst3P21460 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cst3P21460 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cst3P21460 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cst3P21460 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cst3P21460 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cst3P21460 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cst3P21460 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cst3P21460 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cst3P21460 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cst3P21460 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cst3P21460 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cst3P21460 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cst3P21460 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cst3P21460 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cst3P21460 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cst3P21460 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cst3P21460 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cst3P21460 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cst3P21460 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cst3P21460 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cst3P21460 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cst3P21460 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cst3P21460 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cst3P21460 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cst3P21460 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cst3P21460 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cst3P21460 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cst3P21460 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cst3P21460 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cst3P21460 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cst3P21460 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cst3P21460 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cst3P21460 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cst3P21460 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cst3P21460 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cst3P21460 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cst3P21460 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cst3P21460 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cst3P21460 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cst3P21460 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cst3P21460 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cst3P21460 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cst3P21460 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cst3P21460 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cst3P21460 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cst3P21460 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cst3P21460 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cst3P21460 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cst3P21460 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cst3P21460 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cst3P21460 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cst3P21460 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cst3P21460 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cst3P21460 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cst3P21460 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cst3P21460 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cst3P21460 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cst3P21460 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cst3P21460 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cst3P21460 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cst3P21460 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cst3P21460 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cst3P21460 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cst3P21460 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cst3P21460 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cst3P21460 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cst3P21460 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cst3P21460 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cst3P21460 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cst3P21460 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cst3P21460 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cst3P21460 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cst3P21460 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cst3P21460 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cst3P21460 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cst3P21460 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cst3P21460 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cst3P21460 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cst3P21460 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cst3P21460 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms