Protein–RNA interactions for Protein: P0DOV1

Mnda, Interferon-activable protein 205-B, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MndaP0DOV1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
MndaP0DOV1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MndaP0DOV1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MndaP0DOV1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MndaP0DOV1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MndaP0DOV1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MndaP0DOV1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MndaP0DOV1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MndaP0DOV1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MndaP0DOV1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MndaP0DOV1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MndaP0DOV1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MndaP0DOV1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MndaP0DOV1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MndaP0DOV1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MndaP0DOV1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MndaP0DOV1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MndaP0DOV1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MndaP0DOV1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MndaP0DOV1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MndaP0DOV1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MndaP0DOV1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MndaP0DOV1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MndaP0DOV1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MndaP0DOV1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MndaP0DOV1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MndaP0DOV1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MndaP0DOV1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MndaP0DOV1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MndaP0DOV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MndaP0DOV1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MndaP0DOV1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MndaP0DOV1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MndaP0DOV1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MndaP0DOV1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MndaP0DOV1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MndaP0DOV1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MndaP0DOV1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MndaP0DOV1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MndaP0DOV1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MndaP0DOV1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MndaP0DOV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MndaP0DOV1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MndaP0DOV1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MndaP0DOV1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MndaP0DOV1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MndaP0DOV1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MndaP0DOV1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MndaP0DOV1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MndaP0DOV1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MndaP0DOV1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MndaP0DOV1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MndaP0DOV1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MndaP0DOV1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MndaP0DOV1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MndaP0DOV1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MndaP0DOV1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MndaP0DOV1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MndaP0DOV1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MndaP0DOV1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MndaP0DOV1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MndaP0DOV1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MndaP0DOV1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MndaP0DOV1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MndaP0DOV1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MndaP0DOV1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MndaP0DOV1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MndaP0DOV1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MndaP0DOV1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
MndaP0DOV1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MndaP0DOV1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MndaP0DOV1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MndaP0DOV1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MndaP0DOV1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MndaP0DOV1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MndaP0DOV1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MndaP0DOV1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MndaP0DOV1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MndaP0DOV1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MndaP0DOV1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MndaP0DOV1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MndaP0DOV1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MndaP0DOV1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MndaP0DOV1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MndaP0DOV1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MndaP0DOV1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MndaP0DOV1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MndaP0DOV1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MndaP0DOV1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MndaP0DOV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MndaP0DOV1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MndaP0DOV1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MndaP0DOV1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MndaP0DOV1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MndaP0DOV1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MndaP0DOV1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MndaP0DOV1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MndaP0DOV1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MndaP0DOV1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MndaP0DOV1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.1 ms