Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hoxb6P09023 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxb6P09023 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hoxb6P09023 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Hoxb6P09023 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxb6P09023 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hoxb6P09023 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxb6P09023 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxb6P09023 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxb6P09023 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxb6P09023 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb6P09023 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxb6P09023 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxb6P09023 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxb6P09023 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxb6P09023 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxb6P09023 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxb6P09023 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxb6P09023 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxb6P09023 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxb6P09023 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hoxb6P09023 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxb6P09023 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxb6P09023 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxb6P09023 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxb6P09023 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxb6P09023 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hoxb6P09023 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxb6P09023 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxb6P09023 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxb6P09023 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb6P09023 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb6P09023 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb6P09023 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxb6P09023 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxb6P09023 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxb6P09023 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxb6P09023 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxb6P09023 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxb6P09023 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxb6P09023 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxb6P09023 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxb6P09023 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxb6P09023 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxb6P09023 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxb6P09023 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxb6P09023 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxb6P09023 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxb6P09023 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb6P09023 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxb6P09023 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxb6P09023 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxb6P09023 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxb6P09023 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxb6P09023 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxb6P09023 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxb6P09023 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb6P09023 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxb6P09023 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxb6P09023 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxb6P09023 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb6P09023 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb6P09023 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb6P09023 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb6P09023 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb6P09023 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb6P09023 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb6P09023 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb6P09023 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb6P09023 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxb6P09023 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxb6P09023 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxb6P09023 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxb6P09023 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb6P09023 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb6P09023 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb6P09023 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb6P09023 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb6P09023 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb6P09023 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb6P09023 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb6P09023 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb6P09023 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb6P09023 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb6P09023 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb6P09023 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb6P09023 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxb6P09023 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxb6P09023 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb6P09023 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb6P09023 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb6P09023 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb6P09023 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb6P09023 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb6P09023 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb6P09023 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb6P09023 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb6P09023 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb6P09023 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxb6P09023 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms