Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SparcP07214 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SparcP07214 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SparcP07214 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SparcP07214 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SparcP07214 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SparcP07214 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SparcP07214 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SparcP07214 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SparcP07214 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SparcP07214 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SparcP07214 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SparcP07214 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SparcP07214 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SparcP07214 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SparcP07214 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SparcP07214 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SparcP07214 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SparcP07214 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SparcP07214 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SparcP07214 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SparcP07214 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SparcP07214 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SparcP07214 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SparcP07214 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SparcP07214 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SparcP07214 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SparcP07214 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SparcP07214 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SparcP07214 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SparcP07214 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SparcP07214 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SparcP07214 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SparcP07214 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SparcP07214 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SparcP07214 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SparcP07214 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SparcP07214 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SparcP07214 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SparcP07214 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SparcP07214 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SparcP07214 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SparcP07214 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SparcP07214 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SparcP07214 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SparcP07214 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SparcP07214 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SparcP07214 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SparcP07214 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SparcP07214 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SparcP07214 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SparcP07214 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SparcP07214 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SparcP07214 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SparcP07214 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SparcP07214 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SparcP07214 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SparcP07214 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SparcP07214 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SparcP07214 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SparcP07214 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SparcP07214 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SparcP07214 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SparcP07214 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SparcP07214 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SparcP07214 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SparcP07214 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SparcP07214 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SparcP07214 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SparcP07214 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SparcP07214 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SparcP07214 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SparcP07214 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SparcP07214 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SparcP07214 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SparcP07214 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SparcP07214 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SparcP07214 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SparcP07214 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SparcP07214 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SparcP07214 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SparcP07214 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SparcP07214 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SparcP07214 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SparcP07214 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SparcP07214 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SparcP07214 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SparcP07214 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SparcP07214 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SparcP07214 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SparcP07214 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SparcP07214 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SparcP07214 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SparcP07214 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SparcP07214 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SparcP07214 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SparcP07214 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SparcP07214 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SparcP07214 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SparcP07214 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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