Protein–RNA interactions for Protein: P06799

Ifna7, Interferon alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna7P06799 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ifna7P06799 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ifna7P06799 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ifna7P06799 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ifna7P06799 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ifna7P06799 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ifna7P06799 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ifna7P06799 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ifna7P06799 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifna7P06799 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ifna7P06799 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ifna7P06799 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ifna7P06799 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ifna7P06799 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ifna7P06799 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ifna7P06799 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ifna7P06799 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifna7P06799 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifna7P06799 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ifna7P06799 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifna7P06799 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ifna7P06799 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifna7P06799 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ifna7P06799 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifna7P06799 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ifna7P06799 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifna7P06799 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifna7P06799 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifna7P06799 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ifna7P06799 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifna7P06799 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifna7P06799 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifna7P06799 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifna7P06799 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifna7P06799 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifna7P06799 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifna7P06799 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifna7P06799 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifna7P06799 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifna7P06799 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifna7P06799 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifna7P06799 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifna7P06799 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifna7P06799 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifna7P06799 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifna7P06799 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifna7P06799 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifna7P06799 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifna7P06799 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifna7P06799 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifna7P06799 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifna7P06799 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifna7P06799 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifna7P06799 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifna7P06799 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifna7P06799 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifna7P06799 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifna7P06799 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifna7P06799 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifna7P06799 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifna7P06799 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifna7P06799 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifna7P06799 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifna7P06799 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifna7P06799 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifna7P06799 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ifna7P06799 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifna7P06799 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifna7P06799 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifna7P06799 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifna7P06799 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifna7P06799 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifna7P06799 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifna7P06799 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifna7P06799 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifna7P06799 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifna7P06799 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifna7P06799 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifna7P06799 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifna7P06799 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifna7P06799 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifna7P06799 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifna7P06799 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifna7P06799 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifna7P06799 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifna7P06799 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifna7P06799 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifna7P06799 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifna7P06799 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifna7P06799 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifna7P06799 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifna7P06799 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifna7P06799 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifna7P06799 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifna7P06799 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifna7P06799 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifna7P06799 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifna7P06799 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifna7P06799 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifna7P06799 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms