Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Saa1P05366 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Saa1P05366 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Saa1P05366 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Saa1P05366 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Saa1P05366 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Saa1P05366 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Saa1P05366 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Saa1P05366 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Saa1P05366 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Saa1P05366 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Saa1P05366 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Saa1P05366 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Saa1P05366 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Saa1P05366 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Saa1P05366 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Saa1P05366 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Saa1P05366 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Saa1P05366 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Saa1P05366 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Saa1P05366 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Saa1P05366 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Saa1P05366 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Saa1P05366 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Saa1P05366 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Saa1P05366 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Saa1P05366 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Saa1P05366 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Saa1P05366 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Saa1P05366 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Saa1P05366 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Saa1P05366 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Saa1P05366 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Saa1P05366 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Saa1P05366 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Saa1P05366 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Saa1P05366 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Saa1P05366 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Saa1P05366 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Saa1P05366 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Saa1P05366 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Saa1P05366 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Saa1P05366 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Saa1P05366 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Saa1P05366 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Saa1P05366 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Saa1P05366 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Saa1P05366 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Saa1P05366 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Saa1P05366 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Saa1P05366 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Saa1P05366 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Saa1P05366 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Saa1P05366 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Saa1P05366 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Saa1P05366 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Saa1P05366 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Saa1P05366 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Saa1P05366 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Saa1P05366 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Saa1P05366 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Saa1P05366 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Saa1P05366 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Saa1P05366 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Saa1P05366 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Saa1P05366 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Saa1P05366 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Saa1P05366 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Saa1P05366 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Saa1P05366 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Saa1P05366 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Saa1P05366 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Saa1P05366 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Saa1P05366 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Saa1P05366 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Saa1P05366 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Saa1P05366 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Saa1P05366 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Saa1P05366 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Saa1P05366 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saa1P05366 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Saa1P05366 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Saa1P05366 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Saa1P05366 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Saa1P05366 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Saa1P05366 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Saa1P05366 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Saa1P05366 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Saa1P05366 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Saa1P05366 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Saa1P05366 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Saa1P05366 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Saa1P05366 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Saa1P05366 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Saa1P05366 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Saa1P05366 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Saa1P05366 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Saa1P05366 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Saa1P05366 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Saa1P05366 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms