Protein–RNA interactions for Protein: P01845

Iglc3, Ig lambda-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iglc3P01845 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Iglc3P01845 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Iglc3P01845 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Iglc3P01845 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Iglc3P01845 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Iglc3P01845 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Iglc3P01845 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Iglc3P01845 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Iglc3P01845 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Iglc3P01845 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Iglc3P01845 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Iglc3P01845 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Iglc3P01845 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Iglc3P01845 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Iglc3P01845 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Iglc3P01845 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Iglc3P01845 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Iglc3P01845 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Iglc3P01845 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Iglc3P01845 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Iglc3P01845 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iglc3P01845 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Iglc3P01845 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Iglc3P01845 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Iglc3P01845 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Iglc3P01845 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Iglc3P01845 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iglc3P01845 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Iglc3P01845 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Iglc3P01845 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Iglc3P01845 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Iglc3P01845 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Iglc3P01845 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Iglc3P01845 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Iglc3P01845 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Iglc3P01845 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Iglc3P01845 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Iglc3P01845 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Iglc3P01845 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Iglc3P01845 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Iglc3P01845 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Iglc3P01845 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Iglc3P01845 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Iglc3P01845 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Iglc3P01845 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Iglc3P01845 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Iglc3P01845 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Iglc3P01845 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Iglc3P01845 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Iglc3P01845 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Iglc3P01845 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Iglc3P01845 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Iglc3P01845 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Iglc3P01845 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Iglc3P01845 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Iglc3P01845 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Iglc3P01845 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Iglc3P01845 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Iglc3P01845 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Iglc3P01845 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Iglc3P01845 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Iglc3P01845 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Iglc3P01845 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Iglc3P01845 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Iglc3P01845 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Iglc3P01845 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Iglc3P01845 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iglc3P01845 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Iglc3P01845 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Iglc3P01845 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Iglc3P01845 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Iglc3P01845 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Iglc3P01845 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Iglc3P01845 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Iglc3P01845 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Iglc3P01845 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Iglc3P01845 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Iglc3P01845 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iglc3P01845 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iglc3P01845 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Iglc3P01845 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Iglc3P01845 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Iglc3P01845 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Iglc3P01845 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Iglc3P01845 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Iglc3P01845 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Iglc3P01845 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Iglc3P01845 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Iglc3P01845 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Iglc3P01845 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Iglc3P01845 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Iglc3P01845 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Iglc3P01845 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Iglc3P01845 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Iglc3P01845 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Iglc3P01845 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Iglc3P01845 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Iglc3P01845 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Iglc3P01845 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Iglc3P01845 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms