Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ifna1P01572 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ifna1P01572 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ifna1P01572 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ifna1P01572 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifna1P01572 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ifna1P01572 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifna1P01572 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifna1P01572 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifna1P01572 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ifna1P01572 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ifna1P01572 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ifna1P01572 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ifna1P01572 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifna1P01572 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ifna1P01572 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ifna1P01572 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ifna1P01572 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifna1P01572 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifna1P01572 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifna1P01572 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifna1P01572 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifna1P01572 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ifna1P01572 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifna1P01572 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifna1P01572 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifna1P01572 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifna1P01572 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifna1P01572 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifna1P01572 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ifna1P01572 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifna1P01572 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifna1P01572 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifna1P01572 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifna1P01572 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ifna1P01572 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifna1P01572 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifna1P01572 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ifna1P01572 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ifna1P01572 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifna1P01572 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifna1P01572 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifna1P01572 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifna1P01572 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifna1P01572 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifna1P01572 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifna1P01572 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifna1P01572 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifna1P01572 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifna1P01572 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifna1P01572 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifna1P01572 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifna1P01572 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifna1P01572 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifna1P01572 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifna1P01572 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifna1P01572 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifna1P01572 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifna1P01572 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifna1P01572 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifna1P01572 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifna1P01572 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifna1P01572 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifna1P01572 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifna1P01572 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifna1P01572 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifna1P01572 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifna1P01572 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifna1P01572 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifna1P01572 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ifna1P01572 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifna1P01572 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifna1P01572 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifna1P01572 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifna1P01572 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifna1P01572 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifna1P01572 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifna1P01572 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifna1P01572 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifna1P01572 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifna1P01572 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifna1P01572 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifna1P01572 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifna1P01572 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifna1P01572 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifna1P01572 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifna1P01572 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifna1P01572 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifna1P01572 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifna1P01572 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifna1P01572 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifna1P01572 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifna1P01572 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifna1P01572 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifna1P01572 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifna1P01572 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifna1P01572 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifna1P01572 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifna1P01572 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifna1P01572 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms