Protein–RNA interactions for Protein: P00687

Amy1, Alpha-amylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy1P00687 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Amy1P00687 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Amy1P00687 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Amy1P00687 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Amy1P00687 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Amy1P00687 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Amy1P00687 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Amy1P00687 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Amy1P00687 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Amy1P00687 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Amy1P00687 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Amy1P00687 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Amy1P00687 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Amy1P00687 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Amy1P00687 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Amy1P00687 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Amy1P00687 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Amy1P00687 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Amy1P00687 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amy1P00687 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amy1P00687 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Amy1P00687 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Amy1P00687 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Amy1P00687 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amy1P00687 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Amy1P00687 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amy1P00687 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Amy1P00687 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Amy1P00687 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amy1P00687 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Amy1P00687 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Amy1P00687 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Amy1P00687 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Amy1P00687 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amy1P00687 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Amy1P00687 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Amy1P00687 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Amy1P00687 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Amy1P00687 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Amy1P00687 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amy1P00687 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amy1P00687 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Amy1P00687 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Amy1P00687 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Amy1P00687 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amy1P00687 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amy1P00687 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Amy1P00687 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amy1P00687 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Amy1P00687 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amy1P00687 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Amy1P00687 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Amy1P00687 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Amy1P00687 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amy1P00687 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amy1P00687 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amy1P00687 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Amy1P00687 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amy1P00687 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amy1P00687 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Amy1P00687 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amy1P00687 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Amy1P00687 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Amy1P00687 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Amy1P00687 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Amy1P00687 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Amy1P00687 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amy1P00687 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amy1P00687 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Amy1P00687 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Amy1P00687 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Amy1P00687 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Amy1P00687 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Amy1P00687 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Amy1P00687 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Amy1P00687 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Amy1P00687 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Amy1P00687 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Amy1P00687 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Amy1P00687 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Amy1P00687 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Amy1P00687 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Amy1P00687 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Amy1P00687 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Amy1P00687 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Amy1P00687 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Amy1P00687 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Amy1P00687 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Amy1P00687 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Amy1P00687 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Amy1P00687 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Amy1P00687 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amy1P00687 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amy1P00687 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amy1P00687 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amy1P00687 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amy1P00687 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Amy1P00687 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Amy1P00687 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Amy1P00687 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms