Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CcnkO88874 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CcnkO88874 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CcnkO88874 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CcnkO88874 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CcnkO88874 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CcnkO88874 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CcnkO88874 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CcnkO88874 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CcnkO88874 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CcnkO88874 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CcnkO88874 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CcnkO88874 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CcnkO88874 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CcnkO88874 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CcnkO88874 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CcnkO88874 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CcnkO88874 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CcnkO88874 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CcnkO88874 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CcnkO88874 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CcnkO88874 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CcnkO88874 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CcnkO88874 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CcnkO88874 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CcnkO88874 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CcnkO88874 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CcnkO88874 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CcnkO88874 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CcnkO88874 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CcnkO88874 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CcnkO88874 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CcnkO88874 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CcnkO88874 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CcnkO88874 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CcnkO88874 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CcnkO88874 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CcnkO88874 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CcnkO88874 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CcnkO88874 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CcnkO88874 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CcnkO88874 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CcnkO88874 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CcnkO88874 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CcnkO88874 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CcnkO88874 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CcnkO88874 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CcnkO88874 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CcnkO88874 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CcnkO88874 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CcnkO88874 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CcnkO88874 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CcnkO88874 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CcnkO88874 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CcnkO88874 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CcnkO88874 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CcnkO88874 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CcnkO88874 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CcnkO88874 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CcnkO88874 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CcnkO88874 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CcnkO88874 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CcnkO88874 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CcnkO88874 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CcnkO88874 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CcnkO88874 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CcnkO88874 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CcnkO88874 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CcnkO88874 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CcnkO88874 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcnkO88874 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcnkO88874 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcnkO88874 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CcnkO88874 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnkO88874 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnkO88874 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnkO88874 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnkO88874 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnkO88874 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnkO88874 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CcnkO88874 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CcnkO88874 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnkO88874 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CcnkO88874 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CcnkO88874 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnkO88874 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnkO88874 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnkO88874 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnkO88874 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnkO88874 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnkO88874 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnkO88874 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnkO88874 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnkO88874 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcnkO88874 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnkO88874 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnkO88874 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CcnkO88874 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnkO88874 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcnkO88874 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms