Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Snx12O70493 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Snx12O70493 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Snx12O70493 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Snx12O70493 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Snx12O70493 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Snx12O70493 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Snx12O70493 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Snx12O70493 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Snx12O70493 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Snx12O70493 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Snx12O70493 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Snx12O70493 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Snx12O70493 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Snx12O70493 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Snx12O70493 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Snx12O70493 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Snx12O70493 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Snx12O70493 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Snx12O70493 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Snx12O70493 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Snx12O70493 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Snx12O70493 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Snx12O70493 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Snx12O70493 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Snx12O70493 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Snx12O70493 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Snx12O70493 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Snx12O70493 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Snx12O70493 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Snx12O70493 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Snx12O70493 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Snx12O70493 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Snx12O70493 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Snx12O70493 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Snx12O70493 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Snx12O70493 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Snx12O70493 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Snx12O70493 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Snx12O70493 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Snx12O70493 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Snx12O70493 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Snx12O70493 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Snx12O70493 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Snx12O70493 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Snx12O70493 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Snx12O70493 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Snx12O70493 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Snx12O70493 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Snx12O70493 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Snx12O70493 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Snx12O70493 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Snx12O70493 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Snx12O70493 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Snx12O70493 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Snx12O70493 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Snx12O70493 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Snx12O70493 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Snx12O70493 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Snx12O70493 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Snx12O70493 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Snx12O70493 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Snx12O70493 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Snx12O70493 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Snx12O70493 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Snx12O70493 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Snx12O70493 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Snx12O70493 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Snx12O70493 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Snx12O70493 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Snx12O70493 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Snx12O70493 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Snx12O70493 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Snx12O70493 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snx12O70493 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snx12O70493 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snx12O70493 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snx12O70493 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snx12O70493 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snx12O70493 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snx12O70493 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snx12O70493 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snx12O70493 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snx12O70493 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snx12O70493 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snx12O70493 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx12O70493 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx12O70493 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snx12O70493 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Snx12O70493 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snx12O70493 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snx12O70493 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snx12O70493 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snx12O70493 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snx12O70493 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snx12O70493 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snx12O70493 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snx12O70493 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snx12O70493 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snx12O70493 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms