Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Pja1O55176 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Pja1O55176 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pja1O55176 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pja1O55176 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Pja1O55176 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pja1O55176 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pja1O55176 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pja1O55176 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pja1O55176 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pja1O55176 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Pja1O55176 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pja1O55176 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pja1O55176 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Pja1O55176 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pja1O55176 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pja1O55176 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pja1O55176 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Pja1O55176 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Pja1O55176 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Pja1O55176 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pja1O55176 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pja1O55176 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pja1O55176 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pja1O55176 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Pja1O55176 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Pja1O55176 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Pja1O55176 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Pja1O55176 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Pja1O55176 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Pja1O55176 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pja1O55176 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pja1O55176 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Pja1O55176 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pja1O55176 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Pja1O55176 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pja1O55176 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pja1O55176 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pja1O55176 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pja1O55176 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Pja1O55176 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pja1O55176 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pja1O55176 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Pja1O55176 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pja1O55176 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pja1O55176 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pja1O55176 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pja1O55176 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pja1O55176 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pja1O55176 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pja1O55176 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Pja1O55176 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Pja1O55176 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pja1O55176 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pja1O55176 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Pja1O55176 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pja1O55176 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pja1O55176 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pja1O55176 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Pja1O55176 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pja1O55176 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pja1O55176 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pja1O55176 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pja1O55176 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pja1O55176 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pja1O55176 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pja1O55176 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pja1O55176 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pja1O55176 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pja1O55176 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pja1O55176 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pja1O55176 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pja1O55176 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pja1O55176 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pja1O55176 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pja1O55176 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pja1O55176 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pja1O55176 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pja1O55176 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pja1O55176 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pja1O55176 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pja1O55176 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pja1O55176 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pja1O55176 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pja1O55176 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pja1O55176 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pja1O55176 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pja1O55176 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pja1O55176 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pja1O55176 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pja1O55176 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pja1O55176 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pja1O55176 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pja1O55176 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pja1O55176 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pja1O55176 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pja1O55176 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pja1O55176 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pja1O55176 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pja1O55176 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms