Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Syngr1O55100 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Syngr1O55100 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Syngr1O55100 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Syngr1O55100 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Syngr1O55100 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Syngr1O55100 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Syngr1O55100 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Syngr1O55100 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Syngr1O55100 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Syngr1O55100 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Syngr1O55100 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Syngr1O55100 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Syngr1O55100 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Syngr1O55100 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Syngr1O55100 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Syngr1O55100 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Syngr1O55100 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Syngr1O55100 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Syngr1O55100 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Syngr1O55100 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Syngr1O55100 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Syngr1O55100 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Syngr1O55100 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Syngr1O55100 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Syngr1O55100 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Syngr1O55100 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Syngr1O55100 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Syngr1O55100 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Syngr1O55100 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Syngr1O55100 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Syngr1O55100 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Syngr1O55100 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Syngr1O55100 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Syngr1O55100 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Syngr1O55100 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Syngr1O55100 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Syngr1O55100 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Syngr1O55100 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Syngr1O55100 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Syngr1O55100 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Syngr1O55100 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Syngr1O55100 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Syngr1O55100 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Syngr1O55100 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Syngr1O55100 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Syngr1O55100 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Syngr1O55100 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Syngr1O55100 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Syngr1O55100 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Syngr1O55100 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Syngr1O55100 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Syngr1O55100 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Syngr1O55100 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Syngr1O55100 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Syngr1O55100 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Syngr1O55100 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Syngr1O55100 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syngr1O55100 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syngr1O55100 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Syngr1O55100 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syngr1O55100 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syngr1O55100 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Syngr1O55100 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Syngr1O55100 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Syngr1O55100 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Syngr1O55100 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Syngr1O55100 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Syngr1O55100 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Syngr1O55100 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Syngr1O55100 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syngr1O55100 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Syngr1O55100 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Syngr1O55100 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Syngr1O55100 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Syngr1O55100 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Syngr1O55100 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syngr1O55100 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Syngr1O55100 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Syngr1O55100 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Syngr1O55100 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Syngr1O55100 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Syngr1O55100 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Syngr1O55100 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syngr1O55100 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Syngr1O55100 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syngr1O55100 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syngr1O55100 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syngr1O55100 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Syngr1O55100 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syngr1O55100 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syngr1O55100 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syngr1O55100 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syngr1O55100 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syngr1O55100 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syngr1O55100 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Syngr1O55100 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syngr1O55100 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syngr1O55100 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syngr1O55100 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms