Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Psmb10O35955 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Psmb10O35955 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Psmb10O35955 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Psmb10O35955 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Psmb10O35955 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Psmb10O35955 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Psmb10O35955 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psmb10O35955 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psmb10O35955 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psmb10O35955 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Psmb10O35955 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psmb10O35955 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psmb10O35955 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Psmb10O35955 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psmb10O35955 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Psmb10O35955 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psmb10O35955 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psmb10O35955 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Psmb10O35955 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmb10O35955 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmb10O35955 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Psmb10O35955 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psmb10O35955 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmb10O35955 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psmb10O35955 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmb10O35955 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmb10O35955 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psmb10O35955 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psmb10O35955 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmb10O35955 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psmb10O35955 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Psmb10O35955 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmb10O35955 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmb10O35955 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psmb10O35955 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Psmb10O35955 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmb10O35955 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psmb10O35955 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psmb10O35955 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Psmb10O35955 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmb10O35955 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psmb10O35955 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmb10O35955 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmb10O35955 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psmb10O35955 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmb10O35955 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psmb10O35955 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmb10O35955 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psmb10O35955 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psmb10O35955 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psmb10O35955 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Psmb10O35955 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psmb10O35955 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psmb10O35955 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psmb10O35955 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psmb10O35955 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psmb10O35955 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psmb10O35955 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psmb10O35955 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Psmb10O35955 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psmb10O35955 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Psmb10O35955 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psmb10O35955 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psmb10O35955 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psmb10O35955 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psmb10O35955 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psmb10O35955 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Psmb10O35955 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmb10O35955 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psmb10O35955 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psmb10O35955 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmb10O35955 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmb10O35955 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmb10O35955 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmb10O35955 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmb10O35955 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmb10O35955 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmb10O35955 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmb10O35955 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmb10O35955 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmb10O35955 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmb10O35955 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmb10O35955 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmb10O35955 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmb10O35955 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmb10O35955 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psmb10O35955 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmb10O35955 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmb10O35955 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmb10O35955 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmb10O35955 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmb10O35955 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmb10O35955 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmb10O35955 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmb10O35955 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Psmb10O35955 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmb10O35955 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmb10O35955 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmb10O35955 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167 ms