Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Sema6aO35464 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Sema6aO35464 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sema6aO35464 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sema6aO35464 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sema6aO35464 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sema6aO35464 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Sema6aO35464 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sema6aO35464 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sema6aO35464 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sema6aO35464 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema6aO35464 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sema6aO35464 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sema6aO35464 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sema6aO35464 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema6aO35464 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sema6aO35464 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema6aO35464 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sema6aO35464 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sema6aO35464 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sema6aO35464 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema6aO35464 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema6aO35464 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sema6aO35464 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sema6aO35464 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema6aO35464 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema6aO35464 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema6aO35464 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sema6aO35464 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sema6aO35464 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sema6aO35464 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema6aO35464 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema6aO35464 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema6aO35464 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema6aO35464 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema6aO35464 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema6aO35464 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema6aO35464 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema6aO35464 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema6aO35464 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema6aO35464 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema6aO35464 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema6aO35464 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema6aO35464 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sema6aO35464 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sema6aO35464 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema6aO35464 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sema6aO35464 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sema6aO35464 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema6aO35464 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema6aO35464 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sema6aO35464 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sema6aO35464 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema6aO35464 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema6aO35464 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sema6aO35464 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6aO35464 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema6aO35464 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema6aO35464 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sema6aO35464 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sema6aO35464 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema6aO35464 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema6aO35464 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema6aO35464 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6aO35464 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema6aO35464 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema6aO35464 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema6aO35464 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema6aO35464 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema6aO35464 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6aO35464 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6aO35464 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema6aO35464 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema6aO35464 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema6aO35464 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema6aO35464 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema6aO35464 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema6aO35464 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema6aO35464 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6aO35464 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema6aO35464 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6aO35464 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema6aO35464 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema6aO35464 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6aO35464 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6aO35464 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema6aO35464 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema6aO35464 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema6aO35464 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6aO35464 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema6aO35464 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema6aO35464 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema6aO35464 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema6aO35464 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema6aO35464 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6aO35464 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6aO35464 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema6aO35464 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6aO35464 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema6aO35464 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms