Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
H2-ObO35424 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
H2-ObO35424 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
H2-ObO35424 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
H2-ObO35424 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
H2-ObO35424 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H2-ObO35424 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
H2-ObO35424 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H2-ObO35424 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H2-ObO35424 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H2-ObO35424 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
H2-ObO35424 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
H2-ObO35424 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H2-ObO35424 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H2-ObO35424 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
H2-ObO35424 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H2-ObO35424 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H2-ObO35424 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
H2-ObO35424 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H2-ObO35424 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H2-ObO35424 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2-ObO35424 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2-ObO35424 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H2-ObO35424 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H2-ObO35424 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H2-ObO35424 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
H2-ObO35424 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
H2-ObO35424 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H2-ObO35424 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H2-ObO35424 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H2-ObO35424 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2-ObO35424 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
H2-ObO35424 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H2-ObO35424 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2-ObO35424 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2-ObO35424 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2-ObO35424 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
H2-ObO35424 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2-ObO35424 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
H2-ObO35424 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2-ObO35424 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2-ObO35424 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2-ObO35424 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2-ObO35424 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
H2-ObO35424 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2-ObO35424 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2-ObO35424 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2-ObO35424 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2-ObO35424 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2-ObO35424 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2-ObO35424 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
H2-ObO35424 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-ObO35424 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2-ObO35424 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2-ObO35424 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26■■□□□ 1.75
H2-ObO35424 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2-ObO35424 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2-ObO35424 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
H2-ObO35424 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2-ObO35424 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2-ObO35424 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2-ObO35424 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2-ObO35424 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
H2-ObO35424 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-ObO35424 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-ObO35424 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2-ObO35424 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-ObO35424 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2-ObO35424 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2-ObO35424 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2-ObO35424 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2-ObO35424 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2-ObO35424 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2-ObO35424 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2-ObO35424 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2-ObO35424 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2-ObO35424 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2-ObO35424 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2-ObO35424 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2-ObO35424 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2-ObO35424 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
H2-ObO35424 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2-ObO35424 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2-ObO35424 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2-ObO35424 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2-ObO35424 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2-ObO35424 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2-ObO35424 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2-ObO35424 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2-ObO35424 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2-ObO35424 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2-ObO35424 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
H2-ObO35424 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2-ObO35424 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2-ObO35424 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2-ObO35424 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2-ObO35424 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2-ObO35424 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2-ObO35424 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2-ObO35424 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms