Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Kcns1O35173 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Kcns1O35173 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kcns1O35173 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kcns1O35173 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kcns1O35173 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcns1O35173 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcns1O35173 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcns1O35173 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcns1O35173 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcns1O35173 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcns1O35173 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcns1O35173 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kcns1O35173 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcns1O35173 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Kcns1O35173 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kcns1O35173 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kcns1O35173 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kcns1O35173 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kcns1O35173 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcns1O35173 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcns1O35173 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcns1O35173 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcns1O35173 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcns1O35173 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcns1O35173 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcns1O35173 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcns1O35173 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcns1O35173 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcns1O35173 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcns1O35173 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcns1O35173 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcns1O35173 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcns1O35173 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcns1O35173 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcns1O35173 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcns1O35173 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcns1O35173 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcns1O35173 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcns1O35173 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcns1O35173 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcns1O35173 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcns1O35173 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcns1O35173 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcns1O35173 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcns1O35173 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcns1O35173 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcns1O35173 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcns1O35173 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcns1O35173 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcns1O35173 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcns1O35173 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcns1O35173 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kcns1O35173 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcns1O35173 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcns1O35173 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcns1O35173 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcns1O35173 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcns1O35173 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcns1O35173 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcns1O35173 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcns1O35173 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcns1O35173 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcns1O35173 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcns1O35173 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcns1O35173 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcns1O35173 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcns1O35173 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcns1O35173 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcns1O35173 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcns1O35173 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcns1O35173 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcns1O35173 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcns1O35173 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcns1O35173 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcns1O35173 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcns1O35173 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcns1O35173 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcns1O35173 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcns1O35173 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcns1O35173 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcns1O35173 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcns1O35173 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcns1O35173 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcns1O35173 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcns1O35173 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcns1O35173 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcns1O35173 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcns1O35173 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcns1O35173 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcns1O35173 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcns1O35173 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcns1O35173 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcns1O35173 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcns1O35173 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcns1O35173 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcns1O35173 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcns1O35173 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcns1O35173 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcns1O35173 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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