Protein–RNA interactions for Protein: L7N293

Vmn1r104, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r104L7N293 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Vmn1r104L7N293 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vmn1r104L7N293 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Vmn1r104L7N293 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Vmn1r104L7N293 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vmn1r104L7N293 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Vmn1r104L7N293 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vmn1r104L7N293 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vmn1r104L7N293 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Vmn1r104L7N293 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vmn1r104L7N293 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn1r104L7N293 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Vmn1r104L7N293 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Vmn1r104L7N293 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vmn1r104L7N293 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vmn1r104L7N293 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vmn1r104L7N293 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vmn1r104L7N293 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vmn1r104L7N293 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vmn1r104L7N293 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn1r104L7N293 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vmn1r104L7N293 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r104L7N293 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r104L7N293 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn1r104L7N293 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vmn1r104L7N293 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn1r104L7N293 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vmn1r104L7N293 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vmn1r104L7N293 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vmn1r104L7N293 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vmn1r104L7N293 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vmn1r104L7N293 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vmn1r104L7N293 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r104L7N293 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Vmn1r104L7N293 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vmn1r104L7N293 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vmn1r104L7N293 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vmn1r104L7N293 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r104L7N293 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vmn1r104L7N293 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vmn1r104L7N293 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vmn1r104L7N293 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vmn1r104L7N293 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r104L7N293 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn1r104L7N293 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vmn1r104L7N293 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vmn1r104L7N293 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vmn1r104L7N293 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn1r104L7N293 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r104L7N293 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn1r104L7N293 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r104L7N293 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vmn1r104L7N293 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn1r104L7N293 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r104L7N293 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r104L7N293 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn1r104L7N293 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r104L7N293 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r104L7N293 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r104L7N293 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r104L7N293 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r104L7N293 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r104L7N293 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r104L7N293 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r104L7N293 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r104L7N293 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r104L7N293 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r104L7N293 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r104L7N293 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r104L7N293 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r104L7N293 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r104L7N293 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r104L7N293 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r104L7N293 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r104L7N293 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r104L7N293 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r104L7N293 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r104L7N293 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r104L7N293 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r104L7N293 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r104L7N293 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r104L7N293 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn1r104L7N293 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn1r104L7N293 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r104L7N293 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r104L7N293 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r104L7N293 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn1r104L7N293 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn1r104L7N293 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r104L7N293 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn1r104L7N293 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r104L7N293 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn1r104L7N293 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn1r104L7N293 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn1r104L7N293 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn1r104L7N293 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r104L7N293 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r104L7N293 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r104L7N293 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r104L7N293 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms