Protein–RNA interactions for Protein: K7N688

Vmn1r27, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r27K7N688 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Vmn1r27K7N688 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vmn1r27K7N688 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vmn1r27K7N688 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vmn1r27K7N688 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Vmn1r27K7N688 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vmn1r27K7N688 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vmn1r27K7N688 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vmn1r27K7N688 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vmn1r27K7N688 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vmn1r27K7N688 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn1r27K7N688 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vmn1r27K7N688 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vmn1r27K7N688 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Vmn1r27K7N688 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vmn1r27K7N688 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn1r27K7N688 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn1r27K7N688 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vmn1r27K7N688 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vmn1r27K7N688 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vmn1r27K7N688 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vmn1r27K7N688 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vmn1r27K7N688 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn1r27K7N688 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn1r27K7N688 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vmn1r27K7N688 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Vmn1r27K7N688 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vmn1r27K7N688 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vmn1r27K7N688 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vmn1r27K7N688 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Vmn1r27K7N688 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn1r27K7N688 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vmn1r27K7N688 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vmn1r27K7N688 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vmn1r27K7N688 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vmn1r27K7N688 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vmn1r27K7N688 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vmn1r27K7N688 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vmn1r27K7N688 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vmn1r27K7N688 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Vmn1r27K7N688 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Vmn1r27K7N688 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r27K7N688 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vmn1r27K7N688 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vmn1r27K7N688 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vmn1r27K7N688 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vmn1r27K7N688 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vmn1r27K7N688 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vmn1r27K7N688 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vmn1r27K7N688 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vmn1r27K7N688 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vmn1r27K7N688 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r27K7N688 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vmn1r27K7N688 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vmn1r27K7N688 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r27K7N688 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r27K7N688 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Vmn1r27K7N688 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn1r27K7N688 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r27K7N688 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vmn1r27K7N688 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r27K7N688 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Vmn1r27K7N688 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vmn1r27K7N688 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r27K7N688 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r27K7N688 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r27K7N688 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r27K7N688 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r27K7N688 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn1r27K7N688 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r27K7N688 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vmn1r27K7N688 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vmn1r27K7N688 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vmn1r27K7N688 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r27K7N688 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r27K7N688 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vmn1r27K7N688 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r27K7N688 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r27K7N688 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vmn1r27K7N688 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r27K7N688 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r27K7N688 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r27K7N688 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r27K7N688 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r27K7N688 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r27K7N688 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r27K7N688 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r27K7N688 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r27K7N688 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r27K7N688 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r27K7N688 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r27K7N688 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r27K7N688 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r27K7N688 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r27K7N688 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r27K7N688 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r27K7N688 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r27K7N688 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r27K7N688 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r27K7N688 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms