Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Vmn1r12G5E8G1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Vmn1r12G5E8G1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Vmn1r12G5E8G1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Vmn1r12G5E8G1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Vmn1r12G5E8G1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vmn1r12G5E8G1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vmn1r12G5E8G1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vmn1r12G5E8G1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vmn1r12G5E8G1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vmn1r12G5E8G1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Vmn1r12G5E8G1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vmn1r12G5E8G1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vmn1r12G5E8G1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vmn1r12G5E8G1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Vmn1r12G5E8G1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vmn1r12G5E8G1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn1r12G5E8G1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vmn1r12G5E8G1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vmn1r12G5E8G1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vmn1r12G5E8G1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vmn1r12G5E8G1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vmn1r12G5E8G1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vmn1r12G5E8G1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vmn1r12G5E8G1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn1r12G5E8G1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn1r12G5E8G1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vmn1r12G5E8G1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vmn1r12G5E8G1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vmn1r12G5E8G1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Vmn1r12G5E8G1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vmn1r12G5E8G1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vmn1r12G5E8G1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vmn1r12G5E8G1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vmn1r12G5E8G1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vmn1r12G5E8G1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vmn1r12G5E8G1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn1r12G5E8G1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r12G5E8G1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vmn1r12G5E8G1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vmn1r12G5E8G1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vmn1r12G5E8G1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vmn1r12G5E8G1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Vmn1r12G5E8G1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vmn1r12G5E8G1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vmn1r12G5E8G1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn1r12G5E8G1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r12G5E8G1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn1r12G5E8G1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vmn1r12G5E8G1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r12G5E8G1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Vmn1r12G5E8G1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r12G5E8G1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r12G5E8G1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r12G5E8G1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r12G5E8G1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn1r12G5E8G1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn1r12G5E8G1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vmn1r12G5E8G1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r12G5E8G1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r12G5E8G1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Vmn1r12G5E8G1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vmn1r12G5E8G1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vmn1r12G5E8G1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn1r12G5E8G1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn1r12G5E8G1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r12G5E8G1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r12G5E8G1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r12G5E8G1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r12G5E8G1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r12G5E8G1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r12G5E8G1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r12G5E8G1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r12G5E8G1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r12G5E8G1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r12G5E8G1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r12G5E8G1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r12G5E8G1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r12G5E8G1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vmn1r12G5E8G1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r12G5E8G1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r12G5E8G1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r12G5E8G1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r12G5E8G1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r12G5E8G1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r12G5E8G1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r12G5E8G1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r12G5E8G1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r12G5E8G1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r12G5E8G1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r12G5E8G1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r12G5E8G1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r12G5E8G1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn1r12G5E8G1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn1r12G5E8G1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn1r12G5E8G1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms