Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Vmn1r67G5E8C1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Vmn1r67G5E8C1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vmn1r67G5E8C1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vmn1r67G5E8C1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Vmn1r67G5E8C1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vmn1r67G5E8C1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vmn1r67G5E8C1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vmn1r67G5E8C1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn1r67G5E8C1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Vmn1r67G5E8C1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn1r67G5E8C1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vmn1r67G5E8C1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r67G5E8C1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vmn1r67G5E8C1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vmn1r67G5E8C1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vmn1r67G5E8C1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Vmn1r67G5E8C1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vmn1r67G5E8C1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vmn1r67G5E8C1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn1r67G5E8C1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r67G5E8C1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r67G5E8C1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vmn1r67G5E8C1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vmn1r67G5E8C1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn1r67G5E8C1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Vmn1r67G5E8C1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r67G5E8C1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r67G5E8C1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r67G5E8C1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn1r67G5E8C1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r67G5E8C1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vmn1r67G5E8C1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vmn1r67G5E8C1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn1r67G5E8C1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn1r67G5E8C1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r67G5E8C1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Vmn1r67G5E8C1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Vmn1r67G5E8C1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r67G5E8C1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn1r67G5E8C1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r67G5E8C1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r67G5E8C1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r67G5E8C1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vmn1r67G5E8C1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r67G5E8C1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r67G5E8C1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r67G5E8C1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r67G5E8C1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r67G5E8C1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r67G5E8C1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r67G5E8C1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r67G5E8C1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r67G5E8C1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r67G5E8C1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r67G5E8C1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn1r67G5E8C1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r67G5E8C1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vmn1r67G5E8C1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r67G5E8C1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r67G5E8C1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vmn1r67G5E8C1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r67G5E8C1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vmn1r67G5E8C1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r67G5E8C1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r67G5E8C1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn1r67G5E8C1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn1r67G5E8C1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn1r67G5E8C1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r67G5E8C1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r67G5E8C1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r67G5E8C1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r67G5E8C1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r67G5E8C1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r67G5E8C1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r67G5E8C1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r67G5E8C1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r67G5E8C1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r67G5E8C1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r67G5E8C1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r67G5E8C1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r67G5E8C1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r67G5E8C1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r67G5E8C1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r67G5E8C1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r67G5E8C1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r67G5E8C1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r67G5E8C1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r67G5E8C1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r67G5E8C1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r67G5E8C1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r67G5E8C1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms