Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Vmn1r238E9Q373 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Vmn1r238E9Q373 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Vmn1r238E9Q373 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Vmn1r238E9Q373 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Vmn1r238E9Q373 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Vmn1r238E9Q373 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Vmn1r238E9Q373 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Vmn1r238E9Q373 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Vmn1r238E9Q373 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vmn1r238E9Q373 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Vmn1r238E9Q373 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vmn1r238E9Q373 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vmn1r238E9Q373 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vmn1r238E9Q373 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vmn1r238E9Q373 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Vmn1r238E9Q373 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Vmn1r238E9Q373 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vmn1r238E9Q373 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vmn1r238E9Q373 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vmn1r238E9Q373 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vmn1r238E9Q373 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vmn1r238E9Q373 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vmn1r238E9Q373 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vmn1r238E9Q373 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vmn1r238E9Q373 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Vmn1r238E9Q373 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vmn1r238E9Q373 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vmn1r238E9Q373 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vmn1r238E9Q373 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vmn1r238E9Q373 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vmn1r238E9Q373 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vmn1r238E9Q373 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Vmn1r238E9Q373 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vmn1r238E9Q373 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vmn1r238E9Q373 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vmn1r238E9Q373 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Vmn1r238E9Q373 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vmn1r238E9Q373 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vmn1r238E9Q373 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vmn1r238E9Q373 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vmn1r238E9Q373 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn1r238E9Q373 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vmn1r238E9Q373 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vmn1r238E9Q373 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vmn1r238E9Q373 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vmn1r238E9Q373 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn1r238E9Q373 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vmn1r238E9Q373 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn1r238E9Q373 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn1r238E9Q373 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vmn1r238E9Q373 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vmn1r238E9Q373 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vmn1r238E9Q373 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vmn1r238E9Q373 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn1r238E9Q373 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn1r238E9Q373 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn1r238E9Q373 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vmn1r238E9Q373 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vmn1r238E9Q373 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn1r238E9Q373 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn1r238E9Q373 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Vmn1r238E9Q373 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vmn1r238E9Q373 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn1r238E9Q373 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn1r238E9Q373 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vmn1r238E9Q373 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vmn1r238E9Q373 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn1r238E9Q373 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vmn1r238E9Q373 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vmn1r238E9Q373 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vmn1r238E9Q373 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vmn1r238E9Q373 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vmn1r238E9Q373 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vmn1r238E9Q373 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r238E9Q373 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vmn1r238E9Q373 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vmn1r238E9Q373 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vmn1r238E9Q373 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vmn1r238E9Q373 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vmn1r238E9Q373 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r238E9Q373 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r238E9Q373 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r238E9Q373 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vmn1r238E9Q373 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r238E9Q373 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vmn1r238E9Q373 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vmn1r238E9Q373 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vmn1r238E9Q373 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn1r238E9Q373 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vmn1r238E9Q373 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vmn1r238E9Q373 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r238E9Q373 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r238E9Q373 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vmn1r238E9Q373 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r238E9Q373 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r238E9Q373 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r238E9Q373 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms