Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Vmn1r68E9Q0V3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Vmn1r68E9Q0V3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vmn1r68E9Q0V3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vmn1r68E9Q0V3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Vmn1r68E9Q0V3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vmn1r68E9Q0V3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r68E9Q0V3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vmn1r68E9Q0V3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vmn1r68E9Q0V3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vmn1r68E9Q0V3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn1r68E9Q0V3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vmn1r68E9Q0V3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Vmn1r68E9Q0V3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Vmn1r68E9Q0V3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vmn1r68E9Q0V3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vmn1r68E9Q0V3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r68E9Q0V3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vmn1r68E9Q0V3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn1r68E9Q0V3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vmn1r68E9Q0V3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r68E9Q0V3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r68E9Q0V3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r68E9Q0V3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r68E9Q0V3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r68E9Q0V3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r68E9Q0V3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vmn1r68E9Q0V3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r68E9Q0V3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r68E9Q0V3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r68E9Q0V3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r68E9Q0V3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r68E9Q0V3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r68E9Q0V3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r68E9Q0V3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r68E9Q0V3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r68E9Q0V3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r68E9Q0V3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r68E9Q0V3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r68E9Q0V3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r68E9Q0V3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r68E9Q0V3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r68E9Q0V3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn1r68E9Q0V3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vmn1r68E9Q0V3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vmn1r68E9Q0V3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn1r68E9Q0V3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r68E9Q0V3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vmn1r68E9Q0V3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r68E9Q0V3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r68E9Q0V3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r68E9Q0V3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn1r68E9Q0V3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r68E9Q0V3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r68E9Q0V3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r68E9Q0V3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r68E9Q0V3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r68E9Q0V3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r68E9Q0V3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r68E9Q0V3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r68E9Q0V3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r68E9Q0V3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r68E9Q0V3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r68E9Q0V3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r68E9Q0V3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r68E9Q0V3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r68E9Q0V3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r68E9Q0V3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r68E9Q0V3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r68E9Q0V3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r68E9Q0V3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r68E9Q0V3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r68E9Q0V3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r68E9Q0V3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms