Protein–RNA interactions for Protein: D3Z393

Mkrn2os, MCG132465, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2osD3Z393 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Mkrn2osD3Z393 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Mkrn2osD3Z393 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Mkrn2osD3Z393 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Mkrn2osD3Z393 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Mkrn2osD3Z393 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Mkrn2osD3Z393 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Mkrn2osD3Z393 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Mkrn2osD3Z393 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mkrn2osD3Z393 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Mkrn2osD3Z393 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mkrn2osD3Z393 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Mkrn2osD3Z393 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Mkrn2osD3Z393 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Mkrn2osD3Z393 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Mkrn2osD3Z393 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Mkrn2osD3Z393 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Mkrn2osD3Z393 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Mkrn2osD3Z393 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Mkrn2osD3Z393 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Mkrn2osD3Z393 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Mkrn2osD3Z393 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Mkrn2osD3Z393 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Mkrn2osD3Z393 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mkrn2osD3Z393 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mkrn2osD3Z393 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Mkrn2osD3Z393 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mkrn2osD3Z393 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mkrn2osD3Z393 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Mkrn2osD3Z393 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Mkrn2osD3Z393 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mkrn2osD3Z393 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mkrn2osD3Z393 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Mkrn2osD3Z393 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mkrn2osD3Z393 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mkrn2osD3Z393 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mkrn2osD3Z393 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mkrn2osD3Z393 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mkrn2osD3Z393 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mkrn2osD3Z393 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Mkrn2osD3Z393 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Mkrn2osD3Z393 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mkrn2osD3Z393 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mkrn2osD3Z393 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mkrn2osD3Z393 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mkrn2osD3Z393 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mkrn2osD3Z393 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mkrn2osD3Z393 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mkrn2osD3Z393 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mkrn2osD3Z393 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mkrn2osD3Z393 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Mkrn2osD3Z393 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mkrn2osD3Z393 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mkrn2osD3Z393 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mkrn2osD3Z393 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mkrn2osD3Z393 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Mkrn2osD3Z393 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mkrn2osD3Z393 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Mkrn2osD3Z393 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mkrn2osD3Z393 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mkrn2osD3Z393 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mkrn2osD3Z393 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mkrn2osD3Z393 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mkrn2osD3Z393 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mkrn2osD3Z393 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mkrn2osD3Z393 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mkrn2osD3Z393 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mkrn2osD3Z393 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mkrn2osD3Z393 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mkrn2osD3Z393 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mkrn2osD3Z393 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mkrn2osD3Z393 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mkrn2osD3Z393 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mkrn2osD3Z393 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mkrn2osD3Z393 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mkrn2osD3Z393 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mkrn2osD3Z393 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mkrn2osD3Z393 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mkrn2osD3Z393 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mkrn2osD3Z393 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mkrn2osD3Z393 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mkrn2osD3Z393 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mkrn2osD3Z393 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mkrn2osD3Z393 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mkrn2osD3Z393 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mkrn2osD3Z393 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mkrn2osD3Z393 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Mkrn2osD3Z393 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mkrn2osD3Z393 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mkrn2osD3Z393 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mkrn2osD3Z393 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mkrn2osD3Z393 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mkrn2osD3Z393 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mkrn2osD3Z393 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Mkrn2osD3Z393 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mkrn2osD3Z393 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mkrn2osD3Z393 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mkrn2osD3Z393 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mkrn2osD3Z393 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mkrn2osD3Z393 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 389 ms