Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
JrklB2RRL2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
JrklB2RRL2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
JrklB2RRL2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
JrklB2RRL2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
JrklB2RRL2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
JrklB2RRL2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
JrklB2RRL2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
JrklB2RRL2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
JrklB2RRL2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
JrklB2RRL2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
JrklB2RRL2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
JrklB2RRL2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
JrklB2RRL2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
JrklB2RRL2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
JrklB2RRL2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
JrklB2RRL2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
JrklB2RRL2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
JrklB2RRL2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
JrklB2RRL2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
JrklB2RRL2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
JrklB2RRL2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
JrklB2RRL2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
JrklB2RRL2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
JrklB2RRL2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
JrklB2RRL2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
JrklB2RRL2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
JrklB2RRL2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
JrklB2RRL2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
JrklB2RRL2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
JrklB2RRL2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
JrklB2RRL2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
JrklB2RRL2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
JrklB2RRL2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
JrklB2RRL2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
JrklB2RRL2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
JrklB2RRL2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
JrklB2RRL2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
JrklB2RRL2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
JrklB2RRL2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
JrklB2RRL2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
JrklB2RRL2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
JrklB2RRL2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
JrklB2RRL2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
JrklB2RRL2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
JrklB2RRL2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
JrklB2RRL2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
JrklB2RRL2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
JrklB2RRL2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
JrklB2RRL2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
JrklB2RRL2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
JrklB2RRL2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
JrklB2RRL2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
JrklB2RRL2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
JrklB2RRL2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
JrklB2RRL2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
JrklB2RRL2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
JrklB2RRL2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
JrklB2RRL2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
JrklB2RRL2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
JrklB2RRL2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
JrklB2RRL2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
JrklB2RRL2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
JrklB2RRL2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
JrklB2RRL2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
JrklB2RRL2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
JrklB2RRL2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
JrklB2RRL2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
JrklB2RRL2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
JrklB2RRL2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
JrklB2RRL2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
JrklB2RRL2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
JrklB2RRL2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
JrklB2RRL2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
JrklB2RRL2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
JrklB2RRL2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
JrklB2RRL2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
JrklB2RRL2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
JrklB2RRL2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
JrklB2RRL2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
JrklB2RRL2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
JrklB2RRL2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
JrklB2RRL2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
JrklB2RRL2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
JrklB2RRL2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
JrklB2RRL2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
JrklB2RRL2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
JrklB2RRL2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
JrklB2RRL2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
JrklB2RRL2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
JrklB2RRL2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JrklB2RRL2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JrklB2RRL2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
JrklB2RRL2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
JrklB2RRL2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
JrklB2RRL2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
JrklB2RRL2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
JrklB2RRL2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
JrklB2RRL2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
JrklB2RRL2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.5 ms