Protein–RNA interactions for Protein: A2A4F1

Rhox7a, Reproductive homeobox 7A, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox7aA2A4F1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox7aA2A4F1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox7aA2A4F1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rhox7aA2A4F1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rhox7aA2A4F1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rhox7aA2A4F1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rhox7aA2A4F1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rhox7aA2A4F1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rhox7aA2A4F1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rhox7aA2A4F1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rhox7aA2A4F1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhox7aA2A4F1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rhox7aA2A4F1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rhox7aA2A4F1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhox7aA2A4F1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rhox7aA2A4F1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rhox7aA2A4F1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rhox7aA2A4F1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rhox7aA2A4F1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhox7aA2A4F1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhox7aA2A4F1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rhox7aA2A4F1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rhox7aA2A4F1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhox7aA2A4F1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhox7aA2A4F1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhox7aA2A4F1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhox7aA2A4F1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhox7aA2A4F1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhox7aA2A4F1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhox7aA2A4F1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhox7aA2A4F1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhox7aA2A4F1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhox7aA2A4F1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhox7aA2A4F1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rhox7aA2A4F1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rhox7aA2A4F1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rhox7aA2A4F1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rhox7aA2A4F1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rhox7aA2A4F1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhox7aA2A4F1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhox7aA2A4F1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhox7aA2A4F1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhox7aA2A4F1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rhox7aA2A4F1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhox7aA2A4F1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhox7aA2A4F1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox7aA2A4F1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhox7aA2A4F1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhox7aA2A4F1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox7aA2A4F1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox7aA2A4F1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox7aA2A4F1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox7aA2A4F1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox7aA2A4F1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox7aA2A4F1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox7aA2A4F1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox7aA2A4F1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox7aA2A4F1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox7aA2A4F1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox7aA2A4F1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox7aA2A4F1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox7aA2A4F1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox7aA2A4F1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox7aA2A4F1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox7aA2A4F1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox7aA2A4F1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox7aA2A4F1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox7aA2A4F1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox7aA2A4F1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox7aA2A4F1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox7aA2A4F1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox7aA2A4F1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox7aA2A4F1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox7aA2A4F1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox7aA2A4F1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox7aA2A4F1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox7aA2A4F1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox7aA2A4F1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox7aA2A4F1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhox7aA2A4F1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox7aA2A4F1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox7aA2A4F1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhox7aA2A4F1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox7aA2A4F1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox7aA2A4F1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox7aA2A4F1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox7aA2A4F1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox7aA2A4F1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox7aA2A4F1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox7aA2A4F1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox7aA2A4F1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox7aA2A4F1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox7aA2A4F1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox7aA2A4F1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox7aA2A4F1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox7aA2A4F1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox7aA2A4F1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox7aA2A4F1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox7aA2A4F1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox7aA2A4F1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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