Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trbv2A0A0B4J1G8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trbv2A0A0B4J1G8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Trbv2A0A0B4J1G8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trbv2A0A0B4J1G8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Trbv2A0A0B4J1G8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trbv2A0A0B4J1G8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trbv2A0A0B4J1G8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trbv2A0A0B4J1G8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trbv2A0A0B4J1G8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trbv2A0A0B4J1G8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trbv2A0A0B4J1G8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trbv2A0A0B4J1G8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trbv2A0A0B4J1G8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trbv2A0A0B4J1G8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trbv2A0A0B4J1G8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trbv2A0A0B4J1G8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trbv2A0A0B4J1G8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trbv2A0A0B4J1G8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trbv2A0A0B4J1G8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trbv2A0A0B4J1G8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trbv2A0A0B4J1G8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trbv2A0A0B4J1G8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trbv2A0A0B4J1G8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trbv2A0A0B4J1G8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trbv2A0A0B4J1G8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trbv2A0A0B4J1G8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trbv2A0A0B4J1G8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trbv2A0A0B4J1G8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trbv2A0A0B4J1G8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trbv2A0A0B4J1G8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trbv2A0A0B4J1G8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trbv2A0A0B4J1G8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trbv2A0A0B4J1G8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trbv2A0A0B4J1G8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trbv2A0A0B4J1G8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trbv2A0A0B4J1G8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trbv2A0A0B4J1G8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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