Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWC7

Ighv5-15, Immunoglobulin heavy variable 5-15 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ighv5-15A0A0A6YWC7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ighv5-15A0A0A6YWC7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ighv5-15A0A0A6YWC7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighv5-15A0A0A6YWC7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighv5-15A0A0A6YWC7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv5-15A0A0A6YWC7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms