Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ighv5-2A0A0A6YVX8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ighv5-2A0A0A6YVX8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ighv5-2A0A0A6YVX8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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