Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6C7

Tcrg-C4, T cell receptor gamma, constant 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C4A0A075B6C7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcrg-C4A0A075B6C7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcrg-C4A0A075B6C7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tcrg-C4A0A075B6C7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tcrg-C4A0A075B6C7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tcrg-C4A0A075B6C7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcrg-C4A0A075B6C7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcrg-C4A0A075B6C7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcrg-C4A0A075B6C7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcrg-C4A0A075B6C7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcrg-C4A0A075B6C7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcrg-C4A0A075B6C7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcrg-C4A0A075B6C7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcrg-C4A0A075B6C7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcrg-C4A0A075B6C7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcrg-C4A0A075B6C7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcrg-C4A0A075B6C7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcrg-C4A0A075B6C7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcrg-C4A0A075B6C7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcrg-C4A0A075B6C7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcrg-C4A0A075B6C7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcrg-C4A0A075B6C7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcrg-C4A0A075B6C7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcrg-C4A0A075B6C7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcrg-C4A0A075B6C7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcrg-C4A0A075B6C7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcrg-C4A0A075B6C7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcrg-C4A0A075B6C7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcrg-C4A0A075B6C7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcrg-C4A0A075B6C7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcrg-C4A0A075B6C7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcrg-C4A0A075B6C7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcrg-C4A0A075B6C7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcrg-C4A0A075B6C7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcrg-C4A0A075B6C7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcrg-C4A0A075B6C7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcrg-C4A0A075B6C7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcrg-C4A0A075B6C7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcrg-C4A0A075B6C7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcrg-C4A0A075B6C7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcrg-C4A0A075B6C7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcrg-C4A0A075B6C7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcrg-C4A0A075B6C7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcrg-C4A0A075B6C7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcrg-C4A0A075B6C7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcrg-C4A0A075B6C7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcrg-C4A0A075B6C7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcrg-C4A0A075B6C7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcrg-C4A0A075B6C7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcrg-C4A0A075B6C7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcrg-C4A0A075B6C7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcrg-C4A0A075B6C7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcrg-C4A0A075B6C7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcrg-C4A0A075B6C7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcrg-C4A0A075B6C7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcrg-C4A0A075B6C7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms