Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B601

Trav9-1, T cell receptor alpha variable 9-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav9-1A0A075B601 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Trav9-1A0A075B601 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trav9-1A0A075B601 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trav9-1A0A075B601 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trav9-1A0A075B601 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trav9-1A0A075B601 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trav9-1A0A075B601 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trav9-1A0A075B601 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trav9-1A0A075B601 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trav9-1A0A075B601 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trav9-1A0A075B601 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trav9-1A0A075B601 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trav9-1A0A075B601 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trav9-1A0A075B601 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trav9-1A0A075B601 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trav9-1A0A075B601 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav9-1A0A075B601 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav9-1A0A075B601 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trav9-1A0A075B601 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trav9-1A0A075B601 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trav9-1A0A075B601 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trav9-1A0A075B601 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trav9-1A0A075B601 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trav9-1A0A075B601 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trav9-1A0A075B601 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trav9-1A0A075B601 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trav9-1A0A075B601 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Trav9-1A0A075B601 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trav9-1A0A075B601 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trav9-1A0A075B601 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trav9-1A0A075B601 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trav9-1A0A075B601 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trav9-1A0A075B601 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trav9-1A0A075B601 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trav9-1A0A075B601 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trav9-1A0A075B601 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trav9-1A0A075B601 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trav9-1A0A075B601 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trav9-1A0A075B601 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trav9-1A0A075B601 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trav9-1A0A075B601 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trav9-1A0A075B601 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trav9-1A0A075B601 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trav9-1A0A075B601 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trav9-1A0A075B601 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav9-1A0A075B601 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trav9-1A0A075B601 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trav9-1A0A075B601 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trav9-1A0A075B601 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trav9-1A0A075B601 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trav9-1A0A075B601 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trav9-1A0A075B601 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav9-1A0A075B601 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav9-1A0A075B601 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trav9-1A0A075B601 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trav9-1A0A075B601 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trav9-1A0A075B601 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trav9-1A0A075B601 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trav9-1A0A075B601 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav9-1A0A075B601 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trav9-1A0A075B601 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trav9-1A0A075B601 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trav9-1A0A075B601 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trav9-1A0A075B601 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trav9-1A0A075B601 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trav9-1A0A075B601 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trav9-1A0A075B601 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trav9-1A0A075B601 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trav9-1A0A075B601 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trav9-1A0A075B601 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav9-1A0A075B601 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav9-1A0A075B601 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav9-1A0A075B601 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trav9-1A0A075B601 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trav9-1A0A075B601 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav9-1A0A075B601 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trav9-1A0A075B601 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trav9-1A0A075B601 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trav9-1A0A075B601 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trav9-1A0A075B601 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trav9-1A0A075B601 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trav9-1A0A075B601 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trav9-1A0A075B601 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trav9-1A0A075B601 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trav9-1A0A075B601 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trav9-1A0A075B601 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav9-1A0A075B601 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav9-1A0A075B601 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav9-1A0A075B601 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trav9-1A0A075B601 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav9-1A0A075B601 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trav9-1A0A075B601 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trav9-1A0A075B601 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trav9-1A0A075B601 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav9-1A0A075B601 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav9-1A0A075B601 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav9-1A0A075B601 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav9-1A0A075B601 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav9-1A0A075B601 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trav9-1A0A075B601 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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