Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Z2

Tcrg-C2, T-cell receptor gamma, constant 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcrg-C2A0A075B5Z2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcrg-C2A0A075B5Z2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcrg-C2A0A075B5Z2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcrg-C2A0A075B5Z2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcrg-C2A0A075B5Z2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcrg-C2A0A075B5Z2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcrg-C2A0A075B5Z2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tcrg-C2A0A075B5Z2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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