Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms