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Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1
NISCH, Nischarin, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
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Transcript Status
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Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
NISCH
Q9Y2I1
SNORD115.2-201
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59 nt
BASIC
-3.7
□□□□□ -3
NISCH
Q9Y2I1
RNU6ATAC23P-201
ENST00000408448
123 nt
BASIC
-3.71
□□□□□ -3
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-346P-201
ENST00000516288
111 nt
BASIC
-3.71
□□□□□ -3
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-886P-201
ENST00000384319
105 nt
BASIC
-3.72
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-797P-201
ENST00000363101
109 nt
BASIC
-3.74
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-497P-201
ENST00000365316
104 nt
BASIC
-3.74
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
TRGJP-201
ENST00000390338
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-3.74
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
SNORA25.5-201
ENST00000363782
126 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-327P-201
ENST00000516270
127 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
SCARNA15.1-201
ENST00000516384
125 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
MIR4317-201
ENST00000637586
65 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
SNORD45C-201
ENST00000383893
79 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
SNORD116-14-201
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92 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
SNORD116-17-201
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92 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
SNORD116-15-201
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92 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
SNORD116-19-201
ENST00000384729
92 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-255P-201
ENST00000516957
105 nt
BASIC
-3.75
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
RNA5SP224-201
ENST00000365069
126 nt
BASIC
-3.77
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.607-201
ENST00000410597
98 nt
BASIC
-3.77
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-315P-201
ENST00000362666
107 nt
BASIC
-3.78
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
SNORA40.13-201
ENST00000516379
120 nt
BASIC
-3.78
□□□□□ -3.01
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-836P-201
ENST00000362920
107 nt
BASIC
-3.8
□□□□□ -3.02
NISCH
Q9Y2I1
AL117351.2-201
ENST00000513571
157 nt
BASIC
-3.8
□□□□□ -3.02
NISCH
Q9Y2I1
MALAT1.1-201
ENST00000618249
95 nt
BASIC
-3.8
□□□□□ -3.02
NISCH
Q9Y2I1
AL031386.1-201
ENST00000411940
142 nt
TSL 5
BASIC
-3.82
□□□□□ -3.02
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-122P-201
ENST00000516818
107 nt
BASIC
-3.82
□□□□□ -3.02
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.273-201
ENST00000364703
102 nt
BASIC
-3.83
□□□□□ -3.02
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.260-201
ENST00000364628
101 nt
BASIC
-3.85
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-665P-201
ENST00000384639
107 nt
BASIC
-3.85
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
AL031737.1-201
ENST00000450125
223 nt
BASIC
-3.86
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1045P-201
ENST00000516321
107 nt
BASIC
-3.86
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
IGLL4P-201
ENST00000614590
133 nt
BASIC
-3.86
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
MIR548AH-201
ENST00000637109
76 nt
BASIC
-3.87
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.335-201
ENST00000365299
96 nt
BASIC
-3.88
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
RNY1P5-201
ENST00000383890
115 nt
BASIC
-3.88
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.464-201
ENST00000384282
110 nt
BASIC
-3.88
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-411P-201
ENST00000384451
107 nt
BASIC
-3.88
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.506-201
ENST00000384494
102 nt
BASIC
-3.88
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-687P-201
ENST00000516443
89 nt
BASIC
-3.88
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
MIR3134-201
ENST00000579433
74 nt
BASIC
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□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
MIR3938-201
ENST00000582157
103 nt
BASIC
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□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-675P-201
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104 nt
BASIC
-3.9
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-463P-201
ENST00000384340
107 nt
BASIC
-3.9
□□□□□ -3.03
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.261-201
ENST00000364631
102 nt
BASIC
-3.91
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.520-201
ENST00000384556
102 nt
BASIC
-3.92
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-422P-201
ENST00000384632
107 nt
BASIC
-3.92
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-788P-201
ENST00000390967
104 nt
BASIC
-3.92
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
MIR548X-201
ENST00000580069
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BASIC
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□□□□□ -3.04
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Q9Y2I1
MIR450A1-201
ENST00000362262
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BASIC
-3.94
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-940P-201
ENST00000363433
104 nt
BASIC
-3.94
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
snoMBII-202.2-201
ENST00000517263
86 nt
BASIC
-3.95
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.788-201
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BASIC
-3.95
□□□□□ -3.04
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Q9Y2I1
Y_RNA.316-201
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BASIC
-3.96
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1056P-201
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BASIC
-3.96
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-589P-201
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107 nt
BASIC
-3.96
□□□□□ -3.04
NISCH
Q9Y2I1
MT-TG-201
ENST00000387429
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BASIC
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□□□□□ -3.05
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1212P-201
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BASIC
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Q9Y2I1
RNU6-776P-201
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BASIC
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NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1022P-201
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BASIC
-3.99
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NISCH
Q9Y2I1
RNU6-844P-201
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BASIC
-3.99
□□□□□ -3.05
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-663P-201
ENST00000391105
106 nt
BASIC
-4
□□□□□ -3.05
NISCH
Q9Y2I1
AC008267.6-201
ENST00000441664
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BASIC
-4
□□□□□ -3.05
NISCH
Q9Y2I1
MIR545-201
ENST00000385085
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BASIC
-4
□□□□□ -3.05
NISCH
Q9Y2I1
MIR1245B-201
ENST00000636115
69 nt
BASIC
-4.02
□□□□□ -3.05
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1134P-201
ENST00000365156
101 nt
BASIC
-4.03
□□□□□ -3.05
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.722-201
ENST00000517279
114 nt
BASIC
-4.04
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-959P-201
ENST00000384671
107 nt
BASIC
-4.05
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.709-201
ENST00000516952
92 nt
BASIC
-4.05
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.73-201
ENST00000362910
113 nt
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1008P-201
ENST00000384160
104 nt
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
MIR5588-201
ENST00000581890
63 nt
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
SOX2OT_exon4.1-201
ENST00000610449
109 nt
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
MIR548H4-201
ENST00000408689
111 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
MIR488-201
ENST00000365739
83 nt
BASIC
-4.08
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-979P-201
ENST00000383896
107 nt
BASIC
-4.09
□□□□□ -3.06
NISCH
Q9Y2I1
SNORA25.4-201
ENST00000363666
124 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
MIR4712-201
ENST00000583750
82 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.94-201
ENST00000363068
106 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
SNORD30.1-201
ENST00000391309
70 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
MIR4511-201
ENST00000582784
87 nt
BASIC
-4.13
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
AL365222.1-201
ENST00000614661
98 nt
BASIC
-4.13
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1326P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-634P-201
ENST00000459134
106 nt
BASIC
-4.14
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
RNU7-171P-201
ENST00000459581
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BASIC
-4.14
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1255P-201
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112 nt
BASIC
-4.15
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1011P-201
ENST00000384668
107 nt
BASIC
-4.15
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
RNA5SP449-201
ENST00000516871
130 nt
BASIC
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□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
U7.4-201
ENST00000614961
63 nt
BASIC
-4.16
□□□□□ -3.07
NISCH
Q9Y2I1
MIR548AL-201
ENST00000578416
97 nt
BASIC
-4.17
□□□□□ -3.08
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.593-201
ENST00000410292
98 nt
BASIC
-4.18
□□□□□ -3.08
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-1312P-201
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108 nt
BASIC
-4.19
□□□□□ -3.08
NISCH
Q9Y2I1
Y_RNA.345-201
ENST00000365384
92 nt
BASIC
-4.19
□□□□□ -3.08
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-209P-201
ENST00000384118
107 nt
BASIC
-4.19
□□□□□ -3.08
NISCH
Q9Y2I1
AC103706.3-201
ENST00000636297
85 nt
BASIC
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□□□□□ -3.08
NISCH
Q9Y2I1
RNY4P13-201
ENST00000384284
96 nt
BASIC
-4.21
□□□□□ -3.08
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-32P-201
ENST00000383948
107 nt
BASIC
-4.22
□□□□□ -3.09
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-13P-201
ENST00000384248
107 nt
BASIC
-4.22
□□□□□ -3.09
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-12P-201
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107 nt
BASIC
-4.22
□□□□□ -3.09
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Q9Y2I1
RNU6-41P-201
ENST00000384741
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BASIC
-4.22
□□□□□ -3.09
NISCH
Q9Y2I1
RNU6-640P-201
ENST00000363693
105 nt
BASIC
-4.25
□□□□□ -3.09
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