Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ZBED9Q6R2W3 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ZBED9Q6R2W3 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ZBED9Q6R2W3 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.91□□□□□ -2.71
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ZBED9Q6R2W3 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZBED9Q6R2W3 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZBED9Q6R2W3 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZBED9Q6R2W3 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.4 ms